RNA–Protein interactions for RNA: YBL053W

YBL053W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YBL053W, Length 375 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YBL053W	YBL053W	YGL081W	P53156	320 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	YEH2	Q07950	538 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	1.05	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	HFI1	Q12060	488 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	YLR125W	Q12138	136 aa		1.05	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	ERR1	P0CX10	437 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	ERR2	P0CX11	437 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	MRS3	P10566	314 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	GID7	P25569	745 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	OAF3	P36023	863 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	ERC1	P38767	581 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	MAK10	Q02197	733 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	RPM2	Q02773	1202 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	NSE3	Q05541	303 aa		1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	1.04	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	PMR1	P13586	950 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	PDE1	P22434	369 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	LAC1	P28496	418 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	ASK10	P48361	1146 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	STP3	Q05937	343 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	YLR049C	Q12110	428 aa		1.03	□□□□□ -2.24
YBL053W	YBL053W	GPA1	P08539	472 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ARG1	P22768	420 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	AGP2	P38090	596 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	HXT7	P39004	570 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	RPH1	P39956	796 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	MGS1	P40151	587 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YGR210C	P42942	411 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	EKI1	Q03764	534 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YLR455W	Q06188	304 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YLR001C	Q07895	862 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	SET6	Q12529	373 aa		1.02	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	AGA1	P32323	725 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	DID4	P36108	232 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	TIS11	P47977	285 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YGR153W	P48238	217 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	TAM41	P53230	385 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	AAD4	Q07747	329 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	GRC3	Q07845	632 aa		1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	1.01	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	FAB1	P34756	2278 aa		1	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YME1	P32795	747 aa		1	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	1	□□□□□ -2.25	not detected
YBL053W	YBL053W	YTA12	P40341	825 aa		1	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	GUF1	P46943	645 aa		1	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	RTT101	P47050	842 aa		1	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YHM2	Q04013	314 aa		1	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	BMT2	P38278	337 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	FET5	P43561	622 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ECM9	Q02202	377 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YMR027W	Q04371	470 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	HOS1	Q12214	470 aa		0.99	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	STE50	P25344	346 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YKL097C	P34245	136 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ERG7	P38604	731 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	UBX6	P47049	396 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YGL082W	P53155	381 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ASI1	P54074	624 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	RPB8	P20436	146 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	HXT4	P32467	576 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	MRP21	P38175	177 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	IKS1	P47042	667 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	NPA3	P47122	385 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	YNL193W	P53870	558 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	RPN4	Q03465	531 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	BAG7	Q12128	409 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	ARP6	Q12509	438 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YBL053W	YBL053W	CTT1	P06115	562 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	PHO8	P11491	566 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	TIM23	P32897	222 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	SPC34	P36131	295 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	FAT1	P38225	669 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YBL053W	YBL053W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.6 ms