RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621269.4

ATXN3-253, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 936 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-253	ENST00000621269	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	GJD2	Q9UKL4	321 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		28.97	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	PEX10	O60683	326 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	ACER1	Q8TDN7	264 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		28.96	■■■□□ 2.23
ATXN3-253	ENST00000621269	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	HMGCR	P04035	888 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CAPN2	P17655	700 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	MAPK4	P31152	587 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	ERVK-9	P63128	1117 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	ERVK-24	P63145	666 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	UBE3C	Q15386	1083 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	DEFB118	Q96PH6	123 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	DCTPP1	Q9H773	170 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	SWAP70	Q9UH65	585 aa		28.95	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	PRKAB2	O43741	272 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CYP2D6	P10635	497 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	EVX2	Q03828	476 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	SEPT2	Q15019	361 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	DPF3	Q92784	378 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	GPATCH3	Q96I76	525 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		28.94	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	VCAM1	P19320	739 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	GUCY1A2	P33402	732 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269		Q3C1V9	767 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CYP2B6	P20813	491 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		28.92	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.91	■■■□□ 2.22	1e-11	■■■■□ 25.2
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		28.91	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CHGB	P05060	677 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	CCNA1	P78396	465 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	PORCN	Q9H237	461 aa		28.9	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	GPR142	Q7Z601	462 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		28.89	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
ATXN3-253	ENST00000621269	RPTOR	Q8N122	1335 aa		28.89	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	USP17L12	C9JPN9	530 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	USP17L21	D6R901	530 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269		H0YGN5	161 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	C12orf60	Q5U649	245 aa		28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	TRIB2	Q92519	343 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		28.87	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269		A0A1W2PRG0	241 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	CNMD	O75829	334 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	RGS2	P41220	211 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	TRIM32	Q13049	653 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	LBX2	Q6XYB7	198 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	CCDC17	Q96LX7	622 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		28.86	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	CDK8	P49336	464 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	MORN1	Q5T089	497 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	WDR78	Q5VTH9	848 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	SH2D4A	Q9H788	454 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		28.85	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	AKR1B1	P15121	316 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	USP6NL	Q92738	828 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		28.84	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	PLXNB2	O15031	1838 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	ICA1	Q05084	483 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	COG2	Q14746	738 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	CTR9	Q6PD62	1173 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		28.83	■■■□□ 2.21
ATXN3-253	ENST00000621269	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ATXN3-253	ENST00000621269	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ATXN3-253	ENST00000621269	APBA2	Q99767	749 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ATXN3-253	ENST00000621269	BTBD7	Q9P203	1132 aa		28.82	■■■□□ 2.2
ATXN3-253	ENST00000621269	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ATXN3-253	ENST00000621269	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
ATXN3-253	ENST00000621269	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		28.82	■■■□□ 2.2

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