RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598020.3

PNKP-211, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 534 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-211ENST00000598020 BACE1P56817 501 aa24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 NEDD1Q8NHV4 660 aa24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.11■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 USP17L10C9JJH3 530 aa24.1■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.1■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.1■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.1■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 INCENPQ9NQS7 918 aa24.1■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 ANKRD23Q86SG2 305 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 SIAH1Q8IUQ4 282 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 CFHR5Q9BXR6 569 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 RNF186Q9NXI6 227 aa24.09■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 BTBD19C9JJ37 291 aa24.08■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 TFAP4Q01664 338 aa24.08■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 ICA1Q05084 483 aa24.08■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 MTMR2Q13614 643 aa24.08■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PNKP-211ENST00000598020 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.08■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 CYP21A2P08686 494 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TSPY3P0CV98 308 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TSPY8P0CW00 308 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 USP14P54578 494 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 HMGCS2P54868 508 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 ACER1Q8TDN7 264 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 C12orf42Q96LP6 360 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.07■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 A0A1W2PRG0 241 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 NYAP2Q9P242 653 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TMX2Q9Y320 296 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 PCNTO95613 3336 aa24.06■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TSPY2A6NKD2 308 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 EEF2P13639 858 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 NECTIN1Q15223 517 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 SH2D4AQ9H788 454 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.05■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TRPA1O75762 1119 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 NOVP48745 357 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 MKL1Q969V6 931 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 FEZ1Q99689 392 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TOMM22Q9NS69 142 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 NEDD4P46934 1319 aa24.04■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 REC8O95072 547 aa24.03■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 ESR2Q92731 530 aa24.03■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 CEP95Q96GE4 821 aa24.03■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 KRT23Q9C075 422 aa24.03■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.03■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 PDHXO00330 501 aa24.02■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 TTLL1O95922 423 aa24.02■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
PNKP-211ENST00000598020 FOXN1O15353 648 aa24.01■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 DGKZQ13574 1117 aa24.01■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 TREML2Q5T2D2 321 aa24.01■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 LPAR1Q92633 364 aa24.01■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 VCPKMTQ9H867 229 aa24.01■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 MYH4Q9Y623 1939 aa24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 SLC27A2O14975 620 aa24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 B4E1Z4 1266 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 E7EWF7 191 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 KDM4AO75164 1064 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 TRDNQ13061 729 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 CRHR2Q13324 411 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 RNF20Q5VTR2 975 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 TTC14Q96N46 770 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.99■■□□□ 1.43
PNKP-211ENST00000598020 NMT2O60551 498 aa23.98■■□□□ 1.43
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