RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MXD3Q9BW11 206 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 C11orf49Q9H6J7 331 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 REV3LO60673 3130 aa6.7□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 NR1I2O75469 434 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 SNAPC2Q13487 334 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 DLGAP5Q15398 846 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ASB2Q96Q27 587 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 COA1Q9GZY4 146 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 CPA4Q9UI42 421 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 CSADQ9Y600 493 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.69□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 BCRP11274 1271 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 WEE1P30291 646 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PRKAR2BP31323 418 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 FLT3LGP49771 235 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MMP16P51512 607 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 TNFAIP1Q13829 316 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 RASA3Q14644 834 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD23Q86SG2 305 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ZBTB33Q86T24 672 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ERO1BQ86YB8 467 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 USP38Q8NB14 1042 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 GABRQQ9UN88 632 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 USP34Q70CQ2 3546 aa6.68□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 GBF1Q92538 1859 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 LGR5O75473 907 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 COL6A1P12109 1028 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ELNP15502 786 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PBX2P40425 430 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PPIL2Q13356 520 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MTMR3Q13615 1198 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 DCTN1Q14203 1278 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 UBXN4Q92575 508 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 FAM89AQ96GI7 184 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 HINFPQ9BQA5 517 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MIS18AQ9NYP9 233 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 THEGQ9P2T0 379 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PFASO15067 1338 aa6.67□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 NPR3P17342 541 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 COPS6Q7L5N1 327 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 TEPSINQ96N21 525 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.66□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 BACH2Q9BYV9 841 aa6.66□□□□□ -1.34
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TRIM25-208ENST00000574234 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.66□□□□□ -1.34
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TRIM25-208ENST00000574234 HMGCRP04035 888 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 MRE11P49959 708 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PPATQ06203 517 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 PROSER3Q2NL68 480 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 CFAP100Q494V2 611 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.65□□□□□ -1.34
TRIM25-208ENST00000574234 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
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