RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP39.22■■■■□ 3.87
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TFAP4Q01664 338 aa39.21■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICA1Q05084 483 aa39.21■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEDD1Q8NHV4 660 aa39.21■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 WBP1LQ9NX94 342 aa39.21■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPY2A6NKD2 308 aa39.2■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR2Q13614 643 aa39.2■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNL1Q8IU54 200 aa39.2■■■■□ 3.87
CTDNEP1-209ENST00000574205 PTPN18Q99952 460 aa39.2■■■■□ 3.87
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa39.19■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEDD4P46934 1319 aa39.18■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC10AQ8IUN9 316 aa39.18■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa39.18■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa39.17■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa39.17■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ESR2Q92731 530 aa39.16■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNNM2Q9H8M5 875 aa39.16■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIAH1Q8IUQ4 282 aa39.15■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PRG0 241 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTBD19C9JJ37 291 aa39.14■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GADL1Q6ZQY3 521 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM43AQ8N2R8 423 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEP95Q96GE4 821 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH2D4AQ9H788 454 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CA12O43570 354 aa39.14■■■■□ 3.86
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR4Q9NYA4 1195 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 NYAP2Q9P242 653 aa39.14■■■■□ 3.86
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP17L2Q6R6M4 530 aa39.13■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa39.12■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP2B2Q01814 1243 aa39.11■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CREB3L3Q68CJ9 461 aa39.11■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPAT2Q6NUI2 795 aa39.11■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 C12orf42Q96LP6 360 aa39.11■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DGKZQ13574 1117 aa39.1■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EMILIN3Q9NT22 766 aa39.1■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF6LQ9Y6J9 622 aa39.1■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 E7EWF7 191 aa39.09■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPA1O75762 1119 aa39.09■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa39.09■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 KDM4AO75164 1064 aa39.09■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP39.09■■■■□ 3.85
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa39.09■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX2-3Q8TAU0 364 aa39.08■■■■□ 3.85
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TREML2Q5T2D2 321 aa39.07■■■■□ 3.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZSWIM5Q9P217 1185 aa39.05■■■■□ 3.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOVP48745 357 aa39.04■■■■□ 3.84
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