RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 RTL1A6NKG5 1358 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.02□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0G2JLW4 131 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 MMP10P09238 476 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PRELPP51888 382 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 MYBPC2Q14324 1141 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC102BQ68D86 513 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 CASC1Q6TDU7 716 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 BCS1LQ9Y276 419 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.01□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TTC36A6NLP5 189 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 DPEP1P16444 411 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 GPLD1P80108 840 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 CCDC181Q5TID7 509 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PIGBQ92521 554 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 MTA3Q9BTC8 594 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 NRXN2Q9P2S2 1712 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 CARMIL3Q8ND23 1372 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PRR19A6NJB7 356 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 USP17L5A8MUK1 530 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 C21orf2O43822 256 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 C8AP07357 584 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 RARAP10276 462 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TCF3P15923 654 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 EPB42P16452 691 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 AMPHP49418 695 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 MMP14P50281 582 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 LCE4AQ5TA78 99 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 WDR78Q5VTH9 848 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 IER5Q5VY09 327 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM50Q86XT4 487 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 JMYQ8N9B5 988 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 UBXN4Q92575 508 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 IFT43Q96FT9 208 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SCN7AQ01118 1682 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 RAB11FIP3O75154 756 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SASH3O75995 380 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TOMM70O94826 608 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 DDR1Q08345 913 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SETDB1Q15047 1291 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 HMX2A2RU54 273 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 LIG1P18858 919 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 KCNA3P22001 575 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 CHRNA5P30532 468 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SIK1P57059 783 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 CLDN10P78369 228 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 ABI1Q8IZP0 508 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PLD4Q96BZ4 506 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 RNF181Q9P0P0 153 aa6.97□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 INSRP06213 1382 aa6.96□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 FLT4P35916 1363 aa6.96□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.96□□□□□ -1.29
TMOD3-209ENST00000561136 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 CCER2I3L3R5 266 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 NRDCO43847 1150 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SSFA2P28290 1259 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 ATP1A2P50993 1020 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 RNF43Q68DV7 783 aa6.96□□□□□ -1.3
TMOD3-209ENST00000561136 SMC5Q8IY18 1101 aa6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms