RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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PRPF39-212ENST00000557477 TMEM192Q8IY95 271 aa6.96□□□□□ -1.3
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PRPF39-212ENST00000557477 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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PRPF39-212ENST00000557477 LILRB2Q8N423 598 aa6.89□□□□□ -1.31
PRPF39-212ENST00000557477 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.89□□□□□ -1.31
PRPF39-212ENST00000557477 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
PRPF39-212ENST00000557477 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.89□□□□□ -1.31
PRPF39-212ENST00000557477 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PRPF39-212ENST00000557477 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.88□□□□□ -1.31
PRPF39-212ENST00000557477 BBS9Q3SYG4 887 aa6.88□□□□□ -1.31
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