RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556418.1

RIN3-210, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene RIN3, Length 4,079 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-210ENST00000556418 MECOMQ03112 1051 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 ITPK1Q13572 414 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 OXER1Q8TDS5 423 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 RAB34Q9BZG1 259 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CHMP2AO43633 222 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CUTAO60888 179 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 EPSTI1Q96J88 318 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 RUFY1Q96T51 708 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 C6orf50Q9HD87 102 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 AKR1B10O60218 316 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CALML3P27482 149 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 BTDP43251 543 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.67□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 GNAQP50148 359 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CSRNP2Q9H175 543 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 NCAPD2Q15021 1401 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 NEMFO60524 1076 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 SPA17Q15506 151 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 PSMB7Q99436 277 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 JADE2Q9NQC1 790 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 SHPRHQ149N8 1683 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 PSMA7O14818 248 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 NLRP12P59046 1061 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 RICTORQ6R327 1708 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 KIF28PB7ZC32 967 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 DDIT3P35638 169 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 SLC16A2P36021 539 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 PRKG1Q13976 671 aa14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 FAM205CA6NFA0 338 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 KLRF2D3W0D1 207 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 FOXN1O15353 648 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 UBE4AQ14139 1066 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 MCM6Q14566 821 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 CTR9Q6PD62 1173 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 OGFOD1Q8N543 542 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 USP40Q9NVE5 1235 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 PDE4DQ08499 809 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.65□□□□□ -0.06
RIN3-210ENST00000556418 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 KLRK1P26718 216 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SLC39A14Q15043 492 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 MED23Q9ULK4 1368 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 TECP42680 631 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 PHACTR2O75167 634 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SERPINB2P05120 415 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 CMA1P23946 247 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ATL3Q6DD88 541 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 CPXCR1Q8N123 301 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SMCO2A6NFE2 343 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SMIM22K7EJ46 135 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ELF2Q15723 593 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 KRT79Q5XKE5 535 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 CUL5Q93034 780 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 ADGRB2O60241 1585 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 PTPROQ16827 1216 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 POLD4Q9HCU8 107 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 SLC1A4P43007 532 aa14.62□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.62□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RIN3-210ENST00000556418 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms