RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544213.5

PUS1-210, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-210ENST00000544213 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.8■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 RAD50Q92878 1312 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 FOXP2O15409 715 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 GUCY1A2P33402 732 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 SEPT2Q15019 361 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 VPS53Q5VIR6 699 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 FEZ1Q99689 392 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.79■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 SMIM22K7EJ46 135 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 AKR1B1P15121 316 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 ERO1AQ96HE7 468 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 C12orf42Q96LP6 360 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 SH2D4AQ9H788 454 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.78■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 SP3Q02447 781 aa28.77■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 KANSL2Q9H9L4 492 aa28.77■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.77■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.77■■■□□ 2.2
PUS1-210ENST00000544213 FGAP02671 866 aa28.76■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 RASA1P20936 1047 aa28.76■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 OSBPP22059 807 aa28.76■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 ARHGEF6Q15052 776 aa28.76■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 ICA1Q05084 483 aa28.75■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 TREML2Q5T2D2 321 aa28.75■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 ADGRA2Q96PE1 1338 aa28.74■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 C17orf99Q6UX52 265 aa28.74■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 TNS4Q8IZW8 715 aa28.74■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 DSCC1Q9BVC3 393 aa28.74■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.74■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 CHMLP26374 656 aa28.73■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 BMP2KLQ5H9B9 411 aa28.73■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 STK11IPQ8N1F8 1099 aa28.73■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 CYP2C8P10632 490 aa28.72■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 KIF22Q14807 665 aa28.72■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 ACER1Q8TDN7 264 aa28.72■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.71■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 LPAR1Q92633 364 aa28.71■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.71■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 TMX2Q9Y320 296 aa28.71■■■□□ 2.19
PUS1-210ENST00000544213 FGRP09769 529 aa28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 NT5C2P49902 561 aa28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 DGKZQ13574 1117 aa28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.7■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 A0A1W2PRG0 241 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 PRDM1O75626 825 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 TSPY3P0CV98 308 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 TSPY8P0CW00 308 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 NYAP2Q9P242 653 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 CPA4Q9UI42 421 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L15C9J2P7 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L13C9JLJ4 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L11C9JVI0 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L18D6R9N7 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L22D6RA61 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L17D6RBQ6 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L19D6RCP7 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L20D6RJB6 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 ORC4O43929 436 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 GNRH1P01148 92 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 BCRP11274 1271 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 EEF2P13639 858 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 USP17L24Q0WX57 530 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 SIAH1Q8IUQ4 282 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 LAMA4Q16363 1823 aa28.68■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 ZNF213O14771 459 aa28.67■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 VCAM1P19320 739 aa28.67■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 CD99L2Q8TCZ2 262 aa28.67■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 VCPKMTQ9H867 229 aa28.67■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa28.66■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 TFAP4Q01664 338 aa28.66■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 GOPCQ9HD26 462 aa28.66■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 TSPY2A6NKD2 308 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 SGSM2O43147 1006 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 ATP2B2Q01814 1243 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 EFCC1Q9HA90 598 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-210ENST00000544213 MYH4Q9Y623 1939 aa28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms