RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 C16orf46Q6P387 395 aa10.51□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa10.51□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 TONSLQ96HA7 1378 aa10.51□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 EPS15P42566 896 aa10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 MAPK8P45983 427 aa10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ZNF280CQ8ND82 737 aa10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PRO3102Q9H379 93 aa10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 KRBA1A5PL33 1030 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 GNB5O14775 395 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 TREHO43280 583 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SERPINB2P05120 415 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SYT9Q86SS6 491 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 FAM161BQ96MY7 647 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SLC30A3Q99726 388 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SLX4Q8IY92 1834 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa10.49□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 MSTNO14793 375 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 GPC2Q8N158 579 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 STAG2Q8N3U4 1231 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SUSD3Q96L08 255 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 CEP63Q96MT8 703 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 CSRNP1Q96S65 589 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 BRD7Q9NPI1 651 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.48□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 COL4A5P29400 1685 aa10.47□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PLCB3Q01970 1234 aa10.47□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 TYRO3Q06418 890 aa10.47□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 MRS2Q9HD23 443 aa10.47□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PROCP04070 461 aa10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PLA2G5P39877 138 aa10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 DLK2Q6UY11 383 aa10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 MDFIQ99750 246 aa10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PARP2Q9UGN5 583 aa10.46□□□□□ -0.73
LMO3-216ENST00000537568 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa10.46□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 CACNA1SQ13698 1873 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 PIK3R2O00459 728 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 FZD6O60353 706 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 SPEM2Q0P670 501 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 ELOA3BQ3SY89 546 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 COX20Q5RI15 118 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 OLFM4Q6UX06 510 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 ELOA3Q8NG57 546 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 CITED4Q96RK1 184 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 STIM2Q9P246 746 aa10.45□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 SIN3BO75182 1162 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 HUNKP57058 714 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 EHHADHQ08426 723 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 DSC3Q14574 896 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 DMRTB1Q96MA1 342 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 RNF19AQ9NV58 838 aa10.44□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 PIEZO1Q92508 2521 aa10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 TNFRSF10BO14763 440 aa10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 RGMBQ6NW40 437 aa10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 ZNF408Q9H9D4 720 aa10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 BCORQ6W2J9 1755 aa10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 EVC2Q86UK5 1308 aa10.42□□□□□ -0.74
LMO3-216ENST00000537568 GPR182O15218 404 aa10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms