RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP8B1O43520 1251 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 CUL4BQ13620 913 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA1Q92805 767 aa24.5■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 TNKSO95271 1327 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 OAS2P29728 719 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 STAMQ92783 540 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PKN1Q16512 942 aa24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ST5P78524 1137 aa24.48■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 MYH3P11055 1940 aa24.48■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 CHD4Q14839 1912 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 CASP14P31944 242 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 TXLNAP40222 546 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 SEC23AQ15436 765 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 FUT8Q9BYC5 575 aa24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 V9GY48 417 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBTB22O15209 634 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PBX1P40424 430 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 NEK11Q8NG66 645 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 DPYDQ12882 1025 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF174Q15697 407 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 SUSD4Q5VX71 490 aa24.46■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 CYP7A1P22680 504 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 KRT2P35908 639 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 CHMP4BP1P59074 171 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 PHF20Q9BVI0 1012 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.45■■□□□ 1.51
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF5CO60282 957 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 MFAP3LO75121 409 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 XBP1P17861 261 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 RCAN1P53805 252 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ESR2Q92731 530 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCF2Q9UG63 623 aa24.45■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF569Q5MCW4 686 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ZBTB9Q96C00 473 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 MTA3Q9BTC8 594 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ABL1P00519 1130 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 GYPCP04921 128 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 GYS2P54840 703 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 GSDMAQ96QA5 445 aa24.44■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 FUT2Q10981 343 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CTNND2Q9UQB3 1225 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 SLIT2O94813 1529 aa24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.42■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ACRBPQ8NEB7 543 aa24.42■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.42■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC23Q9UJX2 597 aa24.42■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC151A5D8V7 595 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC25AP30304 524 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 FERMT2Q96AC1 680 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 PTGDRQ13258 359 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 RTL9Q8NET4 1388 aa24.41■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 NPY5RQ15761 445 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CNGA4Q8IV77 575 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 NUP98P52948 1817 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 DOCK2Q92608 1830 aa24.4■■□□□ 1.5
TMEM200B-202ENST00000521452 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms