RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 CLRN2A0PK11 232 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 BLACEA4D250 179 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 G3V3G9 751 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAPN9O14815 690 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 PI15O43692 258 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNK5O95279 499 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 STARD3NLO95772 234 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 SP9P0CG40 484 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP2B6P20813 491 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPEM2Q0P670 501 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAAP100Q0VG06 881 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCAF8Q5TAQ9 597 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFXL1Q6ZNB6 911 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 KMT2EQ8IZD2 1858 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 OGFOD1Q8N543 542 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRELD1Q96HD1 420 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 COG3Q96JB2 828 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMLQ99445 158 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPBP1Q9NZL4 362 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMEB2Q9UKD1 530 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTUS1Q9ULD2 1270 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF652Q9Y2D9 606 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRYLO94915 3013 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.97
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL12A1Q99715 3063 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTBP2Q14767 1821 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPTLC1O15269 473 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC28A2O43868 658 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 GDF9O60383 454 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 MSCO60682 206 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIAPH2O60879 1101 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 AOC1P19801 751 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TNFRSF8P28908 595 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 MAP3K9P80192 1104 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 COL19A1Q14993 1142 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIGD5Q53EQ6 642 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPAINQ86UA6 219 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 ERO1BQ86YB8 467 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARRDC4Q8NCT1 418 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 KREMEN2Q8NCW0 462 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMC1Q8TDI8 760 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCAF11Q8TEB1 546 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 NLRP3Q96P20 1036 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUGCTQ9HAC7 445 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 VEZTQ9HBM0 779 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL23AQ9NPF7 189 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 GJD2Q9UKL4 321 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 JMJD1CQ15652 2540 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTBD11A6QL63 1104 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 C6orf229H3BNL8 230 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRNP28799 593 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNGA1P29973 690 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTBRP36941 435 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTHFSP49914 203 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPIL2Q13356 520 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTMR3Q13615 1198 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCEAL5Q5H9L2 206 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 C1orf141Q5JVX7 400 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA1211LQ6NV74 962 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBALD2Q8IYN6 164 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBC1D16Q8TBP0 767 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 STAC3Q96MF2 364 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 IL17BQ9UHF5 180 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD207Q9UJ71 328 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TBX21Q9UL17 535 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAXQ9Y2V3 346 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRK2Q5S007 2527 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 DUOX1Q9NRD9 1551 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 MTORP42345 2549 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF28PB7ZC32 967 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 B8ZZF3 427 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 TM4SF5O14894 197 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-548P-201ENST00000517083 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms