RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.94□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
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SENP6-210ENST00000487548 USP17L7P0C7H9 530 aa5.93□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 LMNB1P20700 586 aa5.93□□□□□ -1.46
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SENP6-210ENST00000487548 GALK1P51570 392 aa5.93□□□□□ -1.46
SENP6-210ENST00000487548 DLG4P78352 724 aa5.93□□□□□ -1.46
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SENP6-210ENST00000487548 Q96M66 194 aa5.92□□□□□ -1.46
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SENP6-210ENST00000487548 PI3P19957 117 aa5.86□□□□□ -1.47
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SENP6-210ENST00000487548 PANK1Q8TE04 598 aa5.86□□□□□ -1.47
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SENP6-210ENST00000487548 UPK3BL2E5RIL1 263 aa5.85□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
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SENP6-210ENST00000487548 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.85□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.85□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 CEP131Q9UPN4 1083 aa5.85□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 PEX10O60683 326 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 TNNI2P48788 182 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 PDE4BQ07343 736 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.84□□□□□ -1.47
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