RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 SLC44A5Q8NCS7 719 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DYNLL2Q96FJ2 89 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 GPATCH3Q96I76 525 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ATP5JP18859 108 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SEPT2Q15019 361 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ACER1Q8TDN7 264 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 HAUS7Q99871 368 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TANGO6Q9C0B7 1094 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L15C9J2P7 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L11C9JVI0 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L18D6R9N7 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L22D6RA61 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L19D6RCP7 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L20D6RJB6 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 IGSF3O75054 1194 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 APPP05067 770 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 GJB1P08034 283 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 SHMT1P34896 483 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ADD2P35612 726 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP14P54578 494 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L24Q0WX57 530 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 PLS1Q14651 629 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 EHD4Q9H223 541 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 GINM1Q9NU53 330 aa9.72□□□□□ -0.85
CTPS1-209ENST00000480420 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 MINDY4BA8MYZ0 360 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L12C9JPN9 530 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 USP17L21D6R901 530 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 H0YGN5 161 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 GJA8P48165 433 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ERVK-9P63128 1117 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ERVK-24P63145 666 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM32Q13049 653 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 Q3C1V9 767 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 SHISA4Q96DD7 197 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 PORCNQ9H237 461 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 RBPJLQ9UBG7 517 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.71□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 SMIM22K7EJ46 135 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 SGPL1O95470 568 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 HMGCRP04035 888 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 AKR1B1P15121 316 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 VCAM1P19320 739 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CNGA1P29973 690 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK4P31152 587 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 SLC4A3P48751 1232 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CCNA1P78396 465 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 IRF5Q13568 498 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 HTATIP2Q9BUP3 242 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 PLXNB2O15031 1838 aa9.7□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 EVI5O60447 810 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 RGS2P41220 211 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 TDO2P48775 406 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CDK8P49336 464 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 ICA1Q05084 483 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CCL14Q16627 93 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM179Q6ZVK1 233 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 GPR142Q7Z601 462 aa9.69□□□□□ -0.86
CTPS1-209ENST00000480420 CHMP4CQ96CF2 233 aa9.69□□□□□ -0.86
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