RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 FEZ1Q99689 392 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.58■■□□□ 1.21
SYF2-203ENST00000474160 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 A0A0D9SFI3 127 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 PDE4BQ07343 736 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 SEPT2Q15019 361 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 FAM227BQ96M60 508 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.57■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 TREML2Q5T2D2 321 aa22.56■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 CYP2C8P10632 490 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 BCRP11274 1271 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 AKR1B1P15121 316 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 PPARAQ07869 468 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 EFCC1Q9HA90 598 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.55■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 NT5C2P49902 561 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 PRMT2P55345 433 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ICA1Q05084 483 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 IFFO2Q5TF58 517 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 LPAR1Q92633 364 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 CPA4Q9UI42 421 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 FOXP2O15409 715 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 RASA1P20936 1047 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ABHD8Q96I13 439 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 TMX2Q9Y320 296 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 TRIM17Q9Y577 477 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 RAD50Q92878 1312 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L15C9J2P7 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L11C9JVI0 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L18D6R9N7 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L22D6RA61 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L19D6RCP7 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L20D6RJB6 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 USP17L24Q0WX57 530 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 ACER1Q8TDN7 264 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-203ENST00000474160 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 SMIM22K7EJ46 135 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 FGAP02671 866 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 HOXD10P28358 340 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 VPS53Q5VIR6 699 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 VCAM1P19320 739 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 NYAP2Q9P242 653 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 A0A1W2PRG0 241 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 FGRP09769 529 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 LBX2Q6XYB7 198 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 VCPKMTQ9H867 229 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 ORC4O43929 436 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 FCGRTP55899 365 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 HERVK_113P62684 666 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 GOPCQ9HD26 462 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 TSPY3P0CV98 308 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 TSPY8P0CW00 308 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 PSMC4P43686 418 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms