RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 SNAPC2Q13487 334 aa23.28■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.28■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.28■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.28■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 KRT23Q9C075 422 aa23.28■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 DOCK1Q14185 1865 aa23.28■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TSPY3P0CV98 308 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TSPY8P0CW00 308 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TFAP4Q01664 338 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 SEPT2Q15019 361 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 ESR2Q92731 530 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 INCENPQ9NQS7 918 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TOMM22Q9NS69 142 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.27■■□□□ 1.32
AUP1-207ENST00000472800 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TSPY2A6NKD2 308 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 C19orf81C9J6K1 198 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CETPP11597 493 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TM4SF4P48230 202 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SREBF2Q12772 1141 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TRDNQ13061 729 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SPP2Q13103 211 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.26■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SLC27A2O14975 620 aa23.25■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.25■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.25■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 USP17L10C9JJH3 530 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SLC34A2O95436 690 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 USP14P54578 494 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 BACE1P56817 501 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 USP26Q9BXU7 913 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 NYAP2Q9P242 653 aa23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TRIM75PA6NK02 468 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 E7EWF7 191 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 ICA1Q05084 483 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 NCOA7Q8NI08 942 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 KCNB2Q92953 911 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SH2D4AQ9H788 454 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 MTMR4Q9NYA4 1195 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 MYH8P13535 1937 aa23.23■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 LAMA4Q16363 1823 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 HSPA4P34932 840 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 MKL1Q969V6 931 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TTC14Q96N46 770 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.22■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TTLL1O95922 423 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 KRT32Q14532 448 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CCL15Q16663 113 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 C8orf34Q49A92 452 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 CEP95Q96GE4 821 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 TMX2Q9Y320 296 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 NEDD4P46934 1319 aa23.21■■□□□ 1.31
AUP1-207ENST00000472800 B4E1Z4 1266 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 KDM4AO75164 1064 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 EEF2P13639 858 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 MCCP23508 829 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 NOVP48745 357 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 IQCA1Q86XH1 822 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.2■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 ALDH1A1P00352 501 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 MTMR2Q13614 643 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 ACER1Q8TDN7 264 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 FEZ1Q99689 392 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.19■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 A0A1W2PRG0 241 aa23.18■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 SOX10P56693 466 aa23.18■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 MOGSQ13724 837 aa23.18■■□□□ 1.3
AUP1-207ENST00000472800 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms