RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470900.1

MANF-202, Transcript of mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene MANF, Length 1,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANF-202ENST00000470900 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.99■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.99■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 ZHX2Q9Y6X8 837 aa29.99■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 USP17L5A8MUK1 530 aa29.98■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.98■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.98■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 VEGFBP49765 207 aa29.97■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 TFAP4Q01664 338 aa29.97■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 PPIL2Q13356 520 aa29.97■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 MCM4P33991 863 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 ECE1P42892 770 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 E7EWF7 191 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 TSPY3P0CV98 308 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 TSPY8P0CW00 308 aa29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
MANF-202ENST00000470900 TSPY2A6NKD2 308 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 IRF6O14896 467 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 AOC2O75106 756 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 RNF20Q5VTR2 975 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 THSD7BQ9C0I4 1608 aa29.95■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.94■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 B4E1Z4 1266 aa29.94■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 ZIC5Q96T25 663 aa29.94■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.93■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 RASEFQ8IZ41 740 aa29.93■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 ESR2Q92731 530 aa29.93■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 CNNM2Q9H8M5 875 aa29.93■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 AS3MTQ9HBK9 375 aa29.93■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 KDM4AO75164 1064 aa29.92■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 SPP2Q13103 211 aa29.92■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 NOGQ13253 232 aa29.92■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.92■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 WDR18Q9BV38 432 aa29.92■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 KRT23Q9C075 422 aa29.92■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 TRIM75PA6NK02 468 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 PTMSP20962 102 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 GSE1Q14687 1217 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 CLEC17AQ6ZS10 378 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 KCNB2Q92953 911 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 NEK4P51957 841 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 ICA1Q05084 483 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 TRDNQ13061 729 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 ACER1Q8TDN7 264 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 CEP95Q96GE4 821 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.91■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 NMT2O60551 498 aa29.9■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 GBP4Q96PP9 640 aa29.9■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.9■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 ZSWIM5Q9P217 1185 aa29.9■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 CXCL11O14625 94 aa29.89■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 NUCB2P80303 420 aa29.89■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 NCOA7Q8NI08 942 aa29.89■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.89■■■□□ 2.38
MANF-202ENST00000470900 A0A1W2PRG0 241 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 ATP2B2Q01814 1243 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 SNAPC2Q13487 334 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 CUL4AQ13619 759 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 SNX14Q9Y5W7 946 aa29.88■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 GTF2A2P52657 109 aa29.87■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 MTMR2Q13614 643 aa29.87■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 TSGA10IPQ3SY00 556 aa29.87■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.87■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 USP17L10C9JJH3 530 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 NT5C2P49902 561 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 DGKZQ13574 1117 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 FEZ1Q99689 392 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 BACE1P56817 501 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 ADCK5Q3MIX3 580 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 NYAP2Q9P242 653 aa29.86■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.85■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 MAP2K2P36507 400 aa29.85■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 HMGCS2P54868 508 aa29.85■■■□□ 2.37
MANF-202ENST00000470900 CCL15Q16663 113 aa29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms