RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463635.1

VWA3B-208, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, human

TSL 3

Gene VWA3B, Length 471 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VWA3B-208	ENST00000463635		A0A1W2PRG0	241 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L15	C9J2P7	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L11	C9JVI0	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L18	D6R9N7	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L22	D6RA61	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L19	D6RCP7	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L20	D6RJB6	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	CYP7A1	P22680	504 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	PTPRE	P23469	700 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	EHD4	Q9H223	541 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		10.16	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	CCER2	I3L3R5	266 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	RGS2	P41220	211 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		10.15	□□□□□ -0.78
VWA3B-208	ENST00000463635	RLF	Q13129	1914 aa		10.15	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	MYH1	P12882	1939 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SMIM22	K7EJ46	135 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	GRB14	Q14449	540 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	GUCD1	Q96NT3	240 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	APBA2	Q99767	749 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.14	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	COBL	O75128	1261 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	VCAM1	P19320	739 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CYP2C19	P33261	490 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SEPT2	Q15019	361 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	LPAR1	Q92633	364 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.13	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CYBA	P13498	195 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	USP14	P54578	494 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	PDE3A	Q14432	1141 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	COG2	Q14746	738 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		10.12	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	USP5	P45974	858 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SNX17	Q15036	470 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	TTC6	Q86TZ1	520 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		10.11	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	DNM1L	O00429	736 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	STRN	O43815	780 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CHGB	P05060	677 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CYP2D6	P10635	497 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ITGB8	P26012	769 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	DSG3	P32926	999 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	CCNA1	P78396	465 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SHH	Q15465	462 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		10.1	□□□□□ -0.79
VWA3B-208	ENST00000463635	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79

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