RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 SERINC3Q13530 473 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-205ENST00000462042 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.47□□□□□ -1.05
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP7A1P22680 504 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 GSK3AP49840 483 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 NCAPHQ15003 741 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 MIPEPQ99797 713 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 CYP27A1Q02318 531 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.45□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 LGR6Q9HBX8 967 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 GSC2O15499 205 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CLEC3AO75596 197 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 UBOX5O94941 541 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PMS1P54277 932 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC113Q9H0I3 377 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 DDAH1O94760 285 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SLITRK5O94991 958 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK5R2Q13319 367 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.43□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 SLC51AQ86UW1 340 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC6A18Q96N87 628 aa8.43□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 NAT2P11245 290 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC7A5Q01650 507 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 RNF43Q68DV7 783 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 VHLLQ6RSH7 139 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 RNF141Q8WVD5 230 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 ASPNQ9BXN1 380 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 MSRB2Q9Y3D2 182 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 GNPTABQ3T906 1256 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM192Q8IY95 271 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM87AP0C7U9 286 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 RASGRF1Q13972 1273 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.4□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 KREMEN1Q96MU8 473 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 EPN3Q9H201 632 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RABGGTB-205ENST00000462042 ST7Q9NRC1 585 aa8.4□□□□□ -1.06
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RABGGTB-205ENST00000462042 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
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RABGGTB-205ENST00000462042 EOMESO95936 686 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 KIR3DL1P43629 444 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 EEPD1Q7L9B9 569 aa8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 PDPK1O15530 556 aa8.38□□□□□ -1.07
RABGGTB-205ENST00000462042 ITGB2P05107 769 aa8.38□□□□□ -1.07
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