RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.62■■□□□ 1.85
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C9orf3-209ENST00000460573 CCL15Q16663 113 aa26.62■■□□□ 1.85
C9orf3-209ENST00000460573 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.62■■□□□ 1.85
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C9orf3-209ENST00000460573 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.62■■□□□ 1.85
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C9orf3-209ENST00000460573 ERO1AQ96HE7 468 aa26.6■■□□□ 1.85
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C9orf3-209ENST00000460573 TSPY8P0CW00 308 aa26.58■■□□□ 1.85
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C9orf3-209ENST00000460573 C19orf81C9J6K1 198 aa26.57■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 USP17L10C9JJH3 530 aa26.57■■□□□ 1.84
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C9orf3-209ENST00000460573 KRT23Q9C075 422 aa26.56■■□□□ 1.84
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C9orf3-209ENST00000460573 NECTIN1Q15223 517 aa26.55■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
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C9orf3-209ENST00000460573 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 USP14P54578 494 aa26.54■■□□□ 1.84
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C9orf3-209ENST00000460573 ARHGEF6Q15052 776 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.54■■□□□ 1.84
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C9orf3-209ENST00000460573 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 NEDD4P46934 1319 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 MTMR2Q13614 643 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf3-209ENST00000460573 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.52■■□□□ 1.84
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C9orf3-209ENST00000460573 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-209ENST00000460573 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-209ENST00000460573 EFCC1Q9HA90 598 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-209ENST00000460573 TMX2Q9Y320 296 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf3-209ENST00000460573 E7EWF7 191 aa26.5■■□□□ 1.83
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C9orf3-209ENST00000460573 HMGCS2P54868 508 aa26.5■■□□□ 1.83
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