RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 CA12O43570 354 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TFAP4Q01664 338 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ICA1Q05084 483 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 MTMR2Q13614 643 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TBC1D10CQ8IV04 446 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 FEZ1Q99689 392 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 NBPF3Q9H094 633 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 RNF186Q9NXI6 227 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.64■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TSPY2A6NKD2 308 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 BTBD19C9JJ37 291 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TRPA1O75762 1119 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 HMGCS2P54868 508 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ACER1Q8TDN7 264 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.63■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 USP14P54578 494 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ATP2B2Q01814 1243 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 MOGSQ13724 837 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 SH2D4AQ9H788 454 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.62■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 CYP21A2P08686 494 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 NT5C2P49902 561 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ESR2Q92731 530 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.61■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 NYAP2Q9P242 653 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.6■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 NEDD4P46934 1319 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 MYH8P13535 1937 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 A0A1W2PRG0 241 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 PDHXO00330 501 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 REC8O95072 547 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 DGKZQ13574 1117 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 CEP95Q96GE4 821 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 KRT23Q9C075 422 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 EMILIN3Q9NT22 766 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TMX2Q9Y320 296 aa21.59■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TTLL1O95922 423 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TRDNQ13061 729 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 C12orf42Q96LP6 360 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.58■■□□□ 1.05
PTX4-202ENST00000440447 B4E1Z4 1266 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 SLC27A2O14975 620 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 FOXN1O15353 648 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 TBC1D8O95759 1140 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 NECTIN1Q15223 517 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 TREML2Q5T2D2 321 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 RNF20Q5VTR2 975 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 CREB3L3Q68CJ9 461 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 CFHR5Q9BXR6 569 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.57■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 E7EWF7 191 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 KDM4AO75164 1064 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 VCPKMTQ9H867 229 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 GOPCQ9HD26 462 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 TSKSQ9UJT2 592 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 PNMA3Q9UL41 463 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 STX8Q9UNK0 236 aa21.56■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 LAMA4Q16363 1823 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 OSBPP22059 807 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 CRHR2Q13324 411 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 IQCA1Q86XH1 822 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 MKL1Q969V6 931 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 PCNTO95613 3336 aa21.55■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 RAD21O60216 631 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 NMT2O60551 498 aa21.54■■□□□ 1.04
PTX4-202ENST00000440447 VCAM1P19320 739 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms