RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 RTN1Q16799 776 aa23.53■■□□□ 1.36
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ODC1-202ENST00000405333 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.53■■□□□ 1.36
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ODC1-202ENST00000405333 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
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ODC1-202ENST00000405333 KAT14Q9H8E8 782 aa23.51■■□□□ 1.35
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ODC1-202ENST00000405333 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa23.51■■□□□ 1.35
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ODC1-202ENST00000405333 FERMT3Q86UX7 667 aa23.46■■□□□ 1.35
ODC1-202ENST00000405333 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.46■■□□□ 1.35
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ODC1-202ENST00000405333 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.45■■□□□ 1.35
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ODC1-202ENST00000405333 CALM2P0DP24 149 aa23.45■■□□□ 1.35
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ODC1-202ENST00000405333 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.44■■□□□ 1.34
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ODC1-202ENST00000405333 F13A1P00488 732 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.44■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ODC1-202ENST00000405333 GRM4Q14833 912 aa23.43■■□□□ 1.34
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