RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 FDX2Q6P4F2 183 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q6ZS46 218 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 C16orf86Q6ZW13 317 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC37L1Q7L3B6 337 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 DYMQ7RTS9 669 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM130Q8N3G9 435 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 DHRS1Q96LJ7 313 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FEZ1Q99689 392 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 BRINP2Q9C0B6 783 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIDD1Q9HB75 910 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 MKL2Q9ULH7 1088 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 IQCA1LA6NCM1 817 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 C9IYK1 514 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CBFA2T2O43439 604 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRIG2O94898 1065 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPROQ16827 1216 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TKFCQ3LXA3 575 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SHISA2Q6UWI4 295 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TREML4Q6UXN2 200 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ARMCX6Q7L4S7 300 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SGSM3Q96HU1 749 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXQ1Q9C009 403 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLHL25Q9H0H3 589 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ACSS3Q9H6R3 686 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PQU0 124 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRBA1A5PL33 1030 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD34BA5PLL1 514 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLEC3AO75596 197 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALX3O95076 343 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPHX1P07099 455 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM153BP0C7A2 387 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 NAT2P11245 290 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 GBP1P32455 592 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PREPP48147 710 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 GYS2P54840 703 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCEA2Q15560 299 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 MFSD2AQ8NA29 543 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC26A8Q96RN1 970 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 HAUS7Q99871 368 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMX1Q9H3N1 280 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM86C1Q9NVL1 165 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFT57Q9NWB7 429 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SHOXO15266 292 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 DNAJC6O75061 913 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ASMTLO95671 621 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CAPNS1P04632 268 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 TP53P04637 393 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAB6AP20340 208 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 GRIK4Q16099 956 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 XAGE3Q8WTP9 111 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 VWCEQ96DN2 955 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 KREMEN1Q96MU8 473 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-655P-201ENST00000362858 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms