RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 IFNL1Q8IU54 200 aa31.7■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 NEDD1Q8NHV4 660 aa31.7■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 BRI3BPQ8WY22 251 aa31.7■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF3Q9H094 633 aa31.7■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 WBP1LQ9NX94 342 aa31.7■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH1A1P00352 501 aa31.69■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 SH3D19Q5HYK7 790 aa31.69■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 TACC3Q9Y6A5 838 aa31.69■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 TSPY2A6NKD2 308 aa31.68■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 REC8O95072 547 aa31.68■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D10CQ8IV04 446 aa31.68■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa31.68■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 CA12O43570 354 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 CYP21A2P08686 494 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ICA1Q05084 483 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 FAM47AQ5JRC9 791 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 PTPN18Q99952 460 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 CNNM2Q9H8M5 875 aa31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 USP14P54578 494 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 MTMR2Q13614 643 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ESR2Q92731 530 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 FEZ1Q99689 392 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 SH2D4AQ9H788 454 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 TMOD4Q9NZQ9 345 aa31.66■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 MYH4Q9Y623 1939 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 PLIN4Q96Q06 1357 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 HMGCS2P54868 508 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 MOGSQ13724 837 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 USP17L2Q6R6M4 530 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 GADL1Q6ZQY3 521 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 KRT23Q9C075 422 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 NYAP2Q9P242 653 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 PCNTO95613 3336 aa31.65■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 NECTIN1Q15223 517 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD23Q86SG2 305 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 SIAH1Q8IUQ4 282 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 ACER1Q8TDN7 264 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 RNF186Q9NXI6 227 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 SAGE1Q9NXZ1 904 aa31.64■■■□□ 2.66
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD19C9JJ37 291 aa31.63■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 EEF2P13639 858 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 TRDNQ13061 729 aa31.63■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 RNF20Q5VTR2 975 aa31.63■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 MTMR4Q9NYA4 1195 aa31.63■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa31.62■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 TMX2Q9Y320 296 aa31.62■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PRG0 241 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 TRPA1O75762 1119 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 ATP2B2Q01814 1243 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 FAM43AQ8N2R8 423 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 CEP95Q96GE4 821 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 LOC285556D6RIA3 1793 aa31.61■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 NEDD4P46934 1319 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL1O95922 423 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 CREB3L3Q68CJ9 461 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 GPAT2Q6NUI2 795 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 MKL1Q969V6 931 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 C12orf42Q96LP6 360 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 EMILIN3Q9NT22 766 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 CLIP2Q9UDT6 1046 aa31.6■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 SLC27A2O14975 620 aa31.59■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC178Q5BJE1 867 aa31.59■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 CLEC10AQ8IUN9 316 aa31.59■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa31.59■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 E7EWF7 191 aa31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 PDHXO00330 501 aa31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 KDM4AO75164 1064 aa31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 NCOA7Q8NI08 942 aa31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 CFHR5Q9BXR6 569 aa31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 IL17RBQ9NRM6 502 aa31.58■■■□□ 2.65
CRIP1-201ENST00000330233 B4E1Z4 1266 aa31.57■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 IQCA1Q86XH1 822 aa31.57■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 GOPCQ9HD26 462 aa31.57■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZSWIM5Q9P217 1185 aa31.57■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 LPAR1Q92633 364 aa31.56■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 TTC14Q96N46 770 aa31.56■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 VCPKMTQ9H867 229 aa31.56■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa31.56■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CRIP1-201ENST00000330233 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms