RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXC6P09630 235 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 RAG1P15918 1043 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPREP23469 700 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 RHBDL3P58872 404 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf53Q5VUE5 145 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG9AQ7Z3C6 839 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 PORCNQ9H237 461 aa9.69□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.69□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 RASGRF1Q13972 1273 aa9.68□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 CLTBP09497 229 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 FPGSQ05932 587 aa9.67□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF576Q9H609 170 aa9.67□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.67□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GUL7 405 aa9.66□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 C12orf42Q96LP6 360 aa9.66□□□□□ -0.86
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PGGT1B-201ENST00000296642 ADCYAP1R1P41586 468 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMM10P62072 90 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K12Q12852 859 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 GRIN2CQ14957 1233 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1EQ8WY54 764 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 XAGE2Q96GT9 111 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 MRS2Q9HD23 443 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 MSRAQ9UJ68 235 aa9.65□□□□□ -0.86
PGGT1B-201ENST00000296642 GDF11O95390 407 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ADORA1P30542 326 aa9.64□□□□□ -0.87
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PGGT1B-201ENST00000296642 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB30Q15771 203 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC6Q86TZ1 520 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 ABRAQ8N0Z2 381 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MB21D1Q8N884 522 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SHCBP1Q8NEM2 672 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 TOX2Q96NM4 488 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 MROH8Q9H579 483 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 FLRT1Q9NZU1 646 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 HMG20BQ9P0W2 317 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.64□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 FLT1P17948 1338 aa9.63□□□□□ -0.87
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0355O15063 1070 aa9.63□□□□□ -0.87
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