RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 4933415A04RikQ9D443 101 aa8.78□□□□□ -1
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Rnase13Q5GAM7 153 aa8.73□□□□□ -1.01
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap1-3A2A588 173 aa8.68□□□□□ -1.02
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defb1P56386 69 aa8.68□□□□□ -1.02
Nisch-221ENSMUST00000171735 Crct1Q6PAI5 102 aa8.65□□□□□ -1.02
Nisch-221ENSMUST00000171735 ZanO88799 5376 aa8.59□□□□□ -1.03
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17416Q30KP4 66 aa8.54□□□□□ -1.04
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cox6b2Q80ZN9 88 aa8.54□□□□□ -1.04
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa8.53□□□□□ -1.04
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap19-1Q925H2 87 aa8.49□□□□□ -1.05
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap19-3Q925H6 87 aa8.48□□□□□ -1.05
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fat4Q2PZL6 4981 aa8.47□□□□□ -1.05
Nisch-221ENSMUST00000171735 LorP18165 486 aa8.44□□□□□ -1.06
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam229aB2KGE5 128 aa8.43□□□□□ -1.06
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sec61gP60060 68 aa8.43□□□□□ -1.06
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10318A0A1W2P728 225 aa8.4□□□□□ -1.06
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm3646F6S692 53 aa8.4□□□□□ -1.07
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm19402J3QJV4 266 aa8.32□□□□□ -1.08
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17606F6ZL36 78 aa8.3□□□□□ -1.08
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap13-1Q8K198 168 aa8.27□□□□□ -1.08
Nisch-221ENSMUST00000171735 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa8.26□□□□□ -1.09
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa8.25□□□□□ -1.09
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufs5Q99LY9 106 aa8.23□□□□□ -1.09
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap3-1A2A591 98 aa8.2□□□□□ -1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10382Q3V0T5 144 aa8.17□□□□□ -1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm9955Q8CEJ8 102 aa8.17□□□□□ -1.1
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap1-5A2A590 122 aa8.15□□□□□ -1.11
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Pla2g10Q9QXX3 151 aa8.08□□□□□ -1.12
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Nisch-221ENSMUST00000171735 BC029722A0A0N4SW31 51 aa7.9□□□□□ -1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa7.9□□□□□ -1.14
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11569B1AQB1 180 aa7.81□□□□□ -1.16
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm19426M0QWC7 77 aa7.81□□□□□ -1.16
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Nisch-221ENSMUST00000171735 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa7.66□□□□□ -1.18
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lce1jD3YUU5 139 aa7.65□□□□□ -1.18
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm12216A0A1W2P827 62 aa7.64□□□□□ -1.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap12-1Q9Z287 130 aa7.64□□□□□ -1.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Romo1P60603 79 aa7.61□□□□□ -1.19
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap19-2Q925I0 141 aa7.59□□□□□ -1.19
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm21887J3QQ04 176 aa7.57□□□□□ -1.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap17-1A2A5X6 109 aa7.53□□□□□ -1.2
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap19-9aF8WH65 55 aa7.48□□□□□ -1.21
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spink7Q6IE32 76 aa7.48□□□□□ -1.21
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11562A0PK51 136 aa7.48□□□□□ -1.21
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa7.47□□□□□ -1.21
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Lce1gQ9D195 139 aa7.41□□□□□ -1.22
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11555B1AQ89 175 aa7.29□□□□□ -1.24
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa7.15□□□□□ -1.26
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11596B1AQB0 205 aa7.14□□□□□ -1.27
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lce1a2Q9D1K4 149 aa7.05□□□□□ -1.28
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm19668J3QMD1 248 aa7.03□□□□□ -1.28
Nisch-221ENSMUST00000171735 Camk2n1Q6QWF9 78 aa7.03□□□□□ -1.28
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa7.03□□□□□ -1.28
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa6.97□□□□□ -1.29
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11564A2A4L9 201 aa6.85□□□□□ -1.31
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11563B1AQ90 168 aa6.85□□□□□ -1.31
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11595B1AQA7 289 aa6.85□□□□□ -1.31
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa6.62□□□□□ -1.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap4-7Q9D732 168 aa6.62□□□□□ -1.35
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Mt4P47945 62 aa6.59□□□□□ -1.35
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa6.57□□□□□ -1.36
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Sprr2kO70562 68 aa6.27□□□□□ -1.41
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa6.25□□□□□ -1.41
Nisch-221ENSMUST00000171735 2300003K06RikA2A4M0 262 aa6.23□□□□□ -1.41
Nisch-221ENSMUST00000171735 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa6.22□□□□□ -1.41
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa6.21□□□□□ -1.42
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa6.18□□□□□ -1.42
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Lce1lQ9D1G7 135 aa6.09□□□□□ -1.43
Nisch-221ENSMUST00000171735 A0A1Y7VLE6 161 aa6.08□□□□□ -1.44
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