RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Abcc8B2RUS7 1588 aa35.06■■■■□ 3.2
Nisch-221ENSMUST00000171735 ScribQ80U72 1612 aa33.53■■■□□ 2.96
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kdm5dQ62240 1548 aa32.53■■■□□ 2.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 NacadQ5SWP3 1504 aa32.53■■■□□ 2.8
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa31.77■■■□□ 2.68
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Baz1aO88379 1555 aa31.35■■■□□ 2.61
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Rtl1Q7M732 1744 aa30.43■■■□□ 2.46
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Wdr62Q3U3T8 1523 aa29.57■■■□□ 2.32
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa29.56■■■□□ 2.32
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa29.49■■■□□ 2.31
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam135aQ6NS59 1506 aa29.35■■■□□ 2.29
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrc2Q64449 1479 aa28.67■■■□□ 2.18
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.66■■■□□ 2.18
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa28.15■■■□□ 2.1
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Nisch-221ENSMUST00000171735 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
Nisch-221ENSMUST00000171735 Grin2bQ01097 1482 aa27.84■■■□□ 2.05
Nisch-221ENSMUST00000171735 Crocc2F6XLV1 1638 aa27.82■■■□□ 2.04
Nisch-221ENSMUST00000171735 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plb1Q3TTY0 1478 aa27.75■■■□□ 2.03
Nisch-221ENSMUST00000171735 Duox2A2AQ99 1517 aa27.75■■■□□ 2.03
Nisch-221ENSMUST00000171735 NrkQ9R0G8 1455 aa27.66■■■□□ 2.02
Nisch-221ENSMUST00000171735 Efcab5A0JP43 1406 aa27.64■■■□□ 2.01
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Nisch-221ENSMUST00000171735 Shroom2A2ALU4 1481 aa27■■□□□ 1.91
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