RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krtap12-1Q9Z287 130 aa10,6□□□□□ -0,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Bud31Q6PGH1 103 aa10,59□□□□□ -0,71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa10,58□□□□□ -0,72
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 A030005K14RikA0A1Y7VNY1 122 aa10,5□□□□□ -0,73
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP10,43□□□□□ -0,74
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lce1a2Q9D1K4 149 aa9,74□□□□□ -0,85
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mt4P47945 62 aa9,73□□□□□ -0,85
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm20661K7N787 53 aa9,65□□□□□ -0,86
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa9,56□□□□□ -0,88
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SmcpP15265 143 aa8,42□□□□□ -1,06
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa8,38□□□□□ -1,07
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rps28P62858 69 aaKnown RBP8,35□□□□□ -1,07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eppk1Q8R0W0 6548 aa8,34□□□□□ -1,07
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 H2al1mQ9DAD9 105 aa8,3□□□□□ -1,08
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lce1kJ3QP15 125 aa8,09□□□□□ -1,11
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