RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CriptO70333 101 aa13.04□□□□□ -0.32
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 HydinQ80W93 5154 aa13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa12.96□□□□□ -0.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm12216A0A1W2P827 62 aa12.94□□□□□ -0.34
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Romo1P60603 79 aa12.86□□□□□ -0.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Birc6O88738 4882 aa12.84□□□□□ -0.35
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lrp2A2ARV4 4660 aa12.82□□□□□ -0.36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa12.8□□□□□ -0.36
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap13-1Q8K198 168 aa12.77□□□□□ -0.37
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 BC029722A0A0N4SW31 51 aa12.62□□□□□ -0.39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm21887J3QQ04 176 aa12.59□□□□□ -0.39
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa12.57□□□□□ -0.4
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm19426M0QWC7 77 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PcloQ9QYX7 5068 aa12.51□□□□□ -0.41
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap1-5A2A590 122 aa12.41□□□□□ -0.42
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm20538F6Z9R1 75 aa12.35□□□□□ -0.43
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10318A0A1W2P728 225 aa12.32□□□□□ -0.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mp68P56379 58 aa12.32□□□□□ -0.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Crct1Q6PAI5 102 aa12.28□□□□□ -0.44
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm19402J3QJV4 266 aa12.23□□□□□ -0.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa12.23□□□□□ -0.45
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm17402F6Z0L5 76 aa12.2□□□□□ -0.46
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fam229aB2KGE5 128 aa12.13□□□□□ -0.47
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spink7Q6IE32 76 aa12.04□□□□□ -0.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap19-1Q925H2 87 aa12.03□□□□□ -0.48
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2a3Q4KL71 83 aa11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Herc1E9PZP8 4859 aa11.97□□□□□ -0.49
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap19-3Q925H6 87 aa11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap7-1Q9D3I6 87 aa11.9□□□□□ -0.5
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ZanO88799 5376 aa11.67□□□□□ -0.54
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prm2P07978 107 aa11.63□□□□□ -0.55
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4932415D10RikA0A1W2P6U8 4986 aa11.58□□□□□ -0.56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ubr4A2AN08 5180 aa11.54□□□□□ -0.56
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1mQ9CR91 182 aa11.52□□□□□ -0.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ush2AQ2QI47 5193 aa11.52□□□□□ -0.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm40193A0A1B0GT39 78 aa11.51□□□□□ -0.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm19668J3QMD1 248 aa11.47□□□□□ -0.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hmcn2A2AJ76 5100 aa11.47□□□□□ -0.57
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Camk2n1Q6QWF9 78 aa11.45□□□□□ -0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap1-3A2A588 173 aa11.42□□□□□ -0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fat4Q2PZL6 4981 aa11.41□□□□□ -0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ndufaf8A2AMZ4 74 aa11.41□□□□□ -0.58
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1jD3YUU5 139 aa11.33□□□□□ -0.6
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 LorP18165 486 aa11.23□□□□□ -0.61
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap12-1Q9Z287 130 aa11.15□□□□□ -0.62
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap19-9aF8WH65 55 aa11.08□□□□□ -0.64
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9789Q8BIG3 52 aa11□□□□□ -0.65
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf213E9Q555 5152 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm18596A0A1W2P860 280 aa10.98□□□□□ -0.65
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap17-1A2A5X6 109 aa10.89□□□□□ -0.67
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Prm1P02319 51 aa10.74□□□□□ -0.69
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm7735D3YX18 52 aa10.72□□□□□ -0.69
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tnp1P10856 55 aa10.69□□□□□ -0.7
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1iQ9D6P5 149 aa10.62□□□□□ -0.71
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap19-2Q925I0 141 aa10.56□□□□□ -0.72
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap8-1O08633 61 aa10.55□□□□□ -0.72
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1a2Q9D1K4 149 aa10.54□□□□□ -0.72
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm9112A2AI92 75 aa10.54□□□□□ -0.72
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap9-5A2A5X3 358 aa10.51□□□□□ -0.73
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 SspoQ8CG65 4998 aa10.51□□□□□ -0.73
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa10.39□□□□□ -0.75
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa10.19□□□□□ -0.78
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa10.14□□□□□ -0.79
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1hQ9D6R3 140 aa10.04□□□□□ -0.8
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10061D3Z714 54 aa9.99□□□□□ -0.81
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm6358A0A087WPH4 74 aa9.9□□□□□ -0.82
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mt2P02798 61 aa9.89□□□□□ -0.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Muc5bE9Q5I3 4800 aa9.88□□□□□ -0.83
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1dQ9D731 133 aa9.37□□□□□ -0.91
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11569B1AQB1 180 aa9.3□□□□□ -0.92
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap22-2J3QNX6 67 aa9.26□□□□□ -0.93
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10272F7CZ33 110 aa9.14□□□□□ -0.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2gO70558 76 aa9.1□□□□□ -0.95
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1eQ9D139 143 aa9.07□□□□□ -0.96
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11938Q9D3H4 131 aa8.93□□□□□ -0.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sprr2dO70555 85 aa8.92□□□□□ -0.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 4933428G20RikQ9D3X4 101 aa8.84□□□□□ -0.99
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11562A0PK51 136 aa8.7□□□□□ -1.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1cQ9D1C5 147 aa8.7□□□□□ -1.02
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-6Q3V4B7 195 aa8.5□□□□□ -1.05
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Syne1Q6ZWR6 8799 aa8.46□□□□□ -1.06
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce3bQ9CQM7 98 aa8.38□□□□□ -1.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap19-4Q925H7 84 aa8.37□□□□□ -1.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1fB9EJP6 147 aa8.36□□□□□ -1.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1a1Q9CQH5 143 aa8.36□□□□□ -1.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10100J3QK64 120 aa8.34□□□□□ -1.07
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa8.29□□□□□ -1.08
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11555B1AQ89 175 aa8.25□□□□□ -1.09
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lce1gQ9D195 139 aa8.18□□□□□ -1.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krtap4-2B1AQ85 167 aa8.16□□□□□ -1.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm10142J3KMP7 120 aa8.15□□□□□ -1.1
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm38119A0A0A6YX29 146 aa8.03□□□□□ -1.12
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fsip2A2ARZ3 6995 aa8.01□□□□□ -1.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mt4P47945 62 aa8.01□□□□□ -1.13
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11596B1AQB0 205 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 141.5 ms