RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001845.12

Capns1-201, Transcript of Calpain small subunit 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene Capns1, Length 1,600 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1-201ENSMUST00000001845 1700042G07RikB1AUF7 90 aa13.33□□□□□ -0.28
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap16-3Q8C1I6 86 aa13.31□□□□□ -0.28
Capns1-201ENSMUST00000001845 Uqcr11Q9CPX8 56 aa13.29□□□□□ -0.28
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap19-1Q925H2 87 aa13.28□□□□□ -0.28
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm10318A0A1W2P728 225 aa13.24□□□□□ -0.29
Capns1-201ENSMUST00000001845 SptssbQ925E8 76 aa13.24□□□□□ -0.29
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm3646F6S692 53 aa13.24□□□□□ -0.29
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm11569B1AQB1 180 aa13.21□□□□□ -0.29
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap4-2B1AQ85 167 aa13.13□□□□□ -0.31
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap1-4Q3V2D6 188 aa13.1□□□□□ -0.31
Capns1-201ENSMUST00000001845 Fam229aB2KGE5 128 aa13.02□□□□□ -0.33
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Capns1-201ENSMUST00000001845 SspoQ8CG65 4998 aa12.91□□□□□ -0.34
Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1gQ9D195 139 aa12.89□□□□□ -0.35
Capns1-201ENSMUST00000001845 Defb38Q7TNV7 63 aa12.88□□□□□ -0.35
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Capns1-201ENSMUST00000001845 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa12.61□□□□□ -0.39
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa12.58□□□□□ -0.4
Capns1-201ENSMUST00000001845 Syne2Q6ZWQ0 6874 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm10999F6Q4M4 69 aa12.57□□□□□ -0.4
Capns1-201ENSMUST00000001845 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa12.52□□□□□ -0.4
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm4491E0CX42 125 aa12.4□□□□□ -0.42
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Capns1-201ENSMUST00000001845 B930094E09RikQ8C4T2 136 aa12.32□□□□□ -0.44
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Muc5bE9Q5I3 4800 aa12.09□□□□□ -0.47
Capns1-201ENSMUST00000001845 2210017I01RikA0A0A6YVV1 95 aa12.08□□□□□ -0.48
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm12216A0A1W2P827 62 aa12.06□□□□□ -0.48
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Cox6b2Q80ZN9 88 aa12.01□□□□□ -0.49
Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1jD3YUU5 139 aa11.97□□□□□ -0.49
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap4-1Q3UUY3 169 aa11.96□□□□□ -0.5
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm20537G3UYK7 97 aa11.92□□□□□ -0.5
Capns1-201ENSMUST00000001845 Mdn1A2ANY6 5589 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap12-1Q9Z287 130 aa11.75□□□□□ -0.53
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm19426M0QWC7 77 aa11.74□□□□□ -0.53
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm11564A2A4L9 201 aa11.71□□□□□ -0.54
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm11563B1AQ90 168 aa11.71□□□□□ -0.54
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm11595B1AQA7 289 aa11.71□□□□□ -0.54
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap3-1A2A591 98 aa11.51□□□□□ -0.57
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm17606F6ZL36 78 aa11.49□□□□□ -0.57
Capns1-201ENSMUST00000001845 Prm2P07978 107 aa11.46□□□□□ -0.58
Capns1-201ENSMUST00000001845 Mp68P56379 58 aa11.44□□□□□ -0.58
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap4-9B1AQA9 244 aa11.34□□□□□ -0.59
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm10382Q3V0T5 144 aa11.32□□□□□ -0.6
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Mt4P47945 62 aa11.14□□□□□ -0.63
Capns1-201ENSMUST00000001845 CriptO70333 101 aa11.13□□□□□ -0.63
Capns1-201ENSMUST00000001845 Fsip2A2ARZ3 6995 aa11.08□□□□□ -0.64
Capns1-201ENSMUST00000001845 Spink7Q6IE32 76 aa11.04□□□□□ -0.64
Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1iQ9D6P5 149 aa11.03□□□□□ -0.64
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap9-3Q3V2C1 136 aa10.92□□□□□ -0.66
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap4-13Q9D7P3 165 aa10.92□□□□□ -0.66
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm17402F6Z0L5 76 aa10.9□□□□□ -0.66
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap6-3A0A087WQL6 57 aa10.89□□□□□ -0.67
Capns1-201ENSMUST00000001845 Mt2P02798 61 aa10.87□□□□□ -0.67
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap8-1O08633 61 aa10.77□□□□□ -0.68
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm21887J3QQ04 176 aa10.7□□□□□ -0.7
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1bQ9D149 137 aa10.68□□□□□ -0.7
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Capns1-201ENSMUST00000001845 Sprr2a3Q4KL71 83 aa10.27□□□□□ -0.77
Capns1-201ENSMUST00000001845 Sprr2a1Q9CQK8 83 aa10.27□□□□□ -0.77
Capns1-201ENSMUST00000001845 Sprr2gO70558 76 aa10.02□□□□□ -0.81
Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1a1Q9CQH5 143 aa10□□□□□ -0.81
Capns1-201ENSMUST00000001845 Gm19668J3QMD1 248 aa9.96□□□□□ -0.81
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap20-2E9Q0A8 60 aa9.96□□□□□ -0.82
Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1hQ9D6R3 140 aa9.9□□□□□ -0.82
Capns1-201ENSMUST00000001845 Lce1eQ9D139 143 aa9.79□□□□□ -0.84
Capns1-201ENSMUST00000001845 Camk2n1Q6QWF9 78 aa9.74□□□□□ -0.85
Capns1-201ENSMUST00000001845 2310046K23RikA0A0A6YVW6 87 aa9.67□□□□□ -0.86
Capns1-201ENSMUST00000001845 Krtap19-9bQ99NG9 58 aa9.64□□□□□ -0.87
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