RNA–Protein interactions for RNA: tL(CAA)C

SUP53, Transcript of Leucine tRNA (tRNA-Leu), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene SUP53, Length 82 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SUP53tL(CAA)C REG1Q00816 1014 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C FDC1Q03034 503 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C YMR160WQ03823 816 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C INP2Q03824 705 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C MSH6Q03834 1242 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C YDL218WQ07629 317 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C PLB3Q08108 686 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C HUA2Q12134 243 aa3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C PRS5Q12265 496 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
SUP53tL(CAA)C BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MIS1P09440 975 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C AAT2P23542 418 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C NTH1P32356 751 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PET112P33893 541 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PHO11P35842 467 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C FTH1P38310 465 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PHO12P38693 467 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C DED81P38707 554 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PTC2P39966 464 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C TMA108P40462 946 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PHO86P46956 311 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C SPC105P53148 917 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C NNF2P53253 936 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C FAR11P53917 953 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C BET4Q00618 327 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C NUP116Q02630 1113 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YDR338CQ05497 695 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C AAD4Q07747 329 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YLR030WQ07967 263 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MCA1Q08601 432 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C OCA6Q12454 224 aa3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MAK16P10962 306 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C OM45P16547 393 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C KAR3P17119 729 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RBK1P25332 333 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C VAC17P25591 423 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C IMG1P25626 169 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C IML3P38265 245 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C SRP72P38688 640 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C LRP1P38801 184 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MTG2P38860 518 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PRM9P39551 298 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RPL34BP40525 121 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MAD1P40957 749 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C ELP2P42935 788 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YFR020WP43600 232 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C CSN12P47130 423 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RTS3P53289 263 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
SUP53tL(CAA)C ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C FRE4P53746 719 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C EMI1Q04406 187 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YLR297WQ05899 129 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C KAP95Q06142 861 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YLR049CQ12110 428 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C AFI1Q99222 893 aa3.82□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C BI2P03873 423 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RNR2P09938 399 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C SCH9P11792 824 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C CLC1P17891 233 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C NAM9P27929 486 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C SBA1P28707 216 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PET309P32522 965 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C EMC3P36039 253 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PXL1P36166 706 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MRPL37P36532 105 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MOH1P38191 138 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C CCT6P39079 546 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C SER3P40054 469 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C DLD2P46681 530 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C TRM9P49957 279 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PEX31P53203 462 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C TIM13P53299 105 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C INN1P53901 409 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C ECM9Q02202 377 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C ROT1Q03691 256 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C SWC7Q06707 132 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C CMS1Q07897 291 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C TRE2Q08693 809 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C RAX1Q08760 435 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YDL177CQ12257 170 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C HER1Q12276 1246 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C YOR338WQ99326 363 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C BI3Q9ZZW7 517 aa3.81□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C COX5AP00424 153 aa3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MTF2P10849 440 aa3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C PUT4P15380 627 aa3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MSP1P28737 362 aa3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C HOG1P32485 435 aa3.8□□□□□ -1.8
SUP53tL(CAA)C MKK1P32490 508 aa3.8□□□□□ -1.8
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