RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	YMR134W	P40207	237 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YJR120W	P47157	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ZIP2	P53061	704 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TNA1	P53322	534 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	FAR8	Q05040	523 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	COQ9	Q05779	260 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	BI2	P03873	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	BI4	P03879	638 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TMT1	P32643	299 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YKR018C	P36114	725 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPC37	P36121	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TVP38	P36164	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	CCL1	P37366	393 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YBR071W	P38243	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	VID24	P38263	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	GIC1	P38785	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YEL025C	P39991	1188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	AIM21	P40563	679 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TDA10	P42938	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ALY2	P47029	1046 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ZAP1	P47043	880 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MET13	P53128	600 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	CUL3	P53202	744 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	DAM1	P53267	343 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TGL2	P54857	326 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HOT1	Q03213	719 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	VPS72	Q03388	795 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YMR321C	Q04898	105 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SHS1	Q07657	551 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MDM38	Q08179	573 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ZPS1	Q12512	249 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ECM3	Q99252	613 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HEM15	P16622	393 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SFL1	P20134	766 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	AEP2	P22136	580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	KIN82	P25341	720 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MGT1	P26188	188 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	FUN30	P31380	1131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SEG2	P34250	1132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HEL1	P36113	551 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	DUG2	P38149	878 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
TRS33	YOR115C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	VAB2	P40003	282 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TMN3	P40071	706 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SAD1	P43589	448 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SCD6	P45978	349 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
TRS33	YOR115C	YJR096W	P47137	282 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HXT16	P47185	567 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YML6	P51998	286 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	UBX4	P54730	416 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SHR3	Q02774	210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TRS130	Q03660	1102 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	HFD1	Q04458	532 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	IVY1	Q04934	453 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YLR177W	Q06251	628 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RSC3	Q06639	885 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YOR378W	Q08902	515 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	OSW2	Q12202	724 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RRD2	Q12461	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PMS1	P14242	873 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SAM35	P14693	329 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	YBR032W	P38223	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	POP4	P38336	279 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PIK1	P39104	1066 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	FTR1	P40088	404 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	KHA1	P40309	873 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	SCS3	P53012	380 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	PUS2	P53167	370 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TRS33	YOR115C	EAR1	Q03212	550 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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