RNA–Protein interactions for RNA: YLR132C

USB1, Transcript of Putative phosphodiesterase specific for U6 snRNA 3' end modification, yeast

Gene USB1, Length 873 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
USB1	YLR132C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	FUI1	P38196	639 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	STB5	P38699	743 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	COS12	P53053	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	USA1	Q03714	838 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	ICT1	Q12385	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	ZPS1	Q12512	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	WHI2	P12611	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	STE4	P18851	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	CLB4	P24871	460 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SDH8	P38345	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SKP2	P42843	763 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SEG1	Q04279	960 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	TPK2	P06245	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	NUC1	P08466	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	MRPL9	P31334	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	YMC1	P32331	307 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	PSF2	P40359	213 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	FMP30	Q02883	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	YAP7	Q08182	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	CRT10	Q08226	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SSM4	P40318	1319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	ERG11	P10614	530 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	RIT1	P23796	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	TMT1	P32643	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SPC72	P39723	622 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	IES5	P40060	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	LAS21	P40367	830 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	SMK1	P41808	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	IML2	P47031	731 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	COQ6	P53318	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	CPR8	P53728	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	CRF1	Q04930	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USB1	YLR132C	AAC1	P04710	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	XRS2	P33301	854 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	NUP120	P35729	1037 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	NPR3	P38742	1146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	PUG1	P40100	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	AAT1	Q01802	451 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	AIM6	Q07716	390 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
USB1	YLR132C	RAD16	P31244	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	CDC5	P32562	705 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	MTG2	P38860	518 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	UME6	P39001	836 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	MAM1	P40065	302 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	OPT1	P40897	799 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	GLO1	P50107	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	SAP4	P53036	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	IMA1	P53051	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	TRS130	Q03660	1102 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ULA1	Q12059	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	PDE1	P22434	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	YCR061W	P25639	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	PSY4	P38193	441 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	RAD26	P40352	1085 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	TAX4	P47030	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	BCK1	Q01389	1478 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	PET122	P10355	254 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	YCL049C	P25577	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	SIP1	P32578	815 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	YGL117W	P53133	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	WAR1	Q03631	944 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ARG7	Q04728	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	ICL2	Q12031	575 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	SRB8	P25648	1427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	BIK1	P11709	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USB1	YLR132C	NUP1	P20676	1076 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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