RNA–Protein interactions for RNA: YLR007W

NSE1, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeast

Gene NSE1, Length 1,011 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE1	YLR007W	YEL068C	P39977	110 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	JEM1	P40358	645 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YML6	P51998	286 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SAP4	P53036	818 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	VTI1	Q04338	217 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YKU80	Q04437	629 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TFC6	Q06339	672 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SUL2	Q12325	893 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SEC12	P11655	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	XRS2	P33301	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	STF1	P01098	86 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	AMD2	P22580	549 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CDC5	P32562	705 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CCL1	P37366	393 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YGL117W	P53133	265 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CRD1	Q07560	283 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	AIM6	Q07716	390 aa		4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	NUC1	P08466	329 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	BET2	P20133	325 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CLB4	P24871	460 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YCR061W	P25639	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TAF5	P38129	798 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	IDS2	P46958	469 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	FCP1	Q03254	732 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	ARA2	Q04212	335 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TAF11	Q04226	346 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CRF1	Q04930	467 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	TPK2	P06245	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YCL049C	P25577	312 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YMC1	P32331	307 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	GDA1	P32621	518 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	ORC2	P32833	620 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	BYE1	P36106	594 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	SDH8	P38345	138 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	MUP3	P38734	546 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	YIL166C	P40445	542 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CIR1	P42940	261 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	IRC6	P43615	237 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	VPS64	Q03944	604 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	ARG7	Q04728	441 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	PGC1	Q08959	321 aa		4.78	□□□□□ -1.64
NSE1	YLR007W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RED1	P14291	827 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	VPS34	P22543	875 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	DPH2	P32461	534 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	FLO10	P36170	1169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	UME6	P39001	836 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CAB2	P40506	365 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CBK1	P53894	756 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	TIM10	P87108	93 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SFI1	Q12369	946 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	BNR1	P40450	1375 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	SEM1	O94742	89 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	MET8	P15807	274 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
NSE1	YLR007W	ATF1	P40353	525 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	AXL1	P40851	1208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YFL015C	P43578	164 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	IMA1	P53051	589 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	UBP16	Q02863	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PDX1	P16451	410 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CDC43	P18898	376 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RPC53	P25441	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	AXL2	P38928	823 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	PSF2	P40359	213 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	RIC1	P40395	1056 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	UBP7	P40453	1071 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
NSE1	YLR007W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	COQ6	P53318	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	CPR8	P53728	308 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	YML053C	Q04978	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NSE1	YLR007W	VID22	Q05934	901 aa		4.75	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.7 ms