RNA–Protein interactions for RNA: YBL018C

POP8, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP8, Length 402 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP8	YBL018C	RAD34	Q06665	692 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	PCD1	Q12524	340 aa		4.62	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	ERG11	P10614	530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	PSY4	P38193	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	CTF18	P49956	741 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	COQ11	Q05892	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.61	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	GEX2	P36173	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	MRPL36	P36531	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	APD1	P38281	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	SKP2	P42843	763 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	CIR1	P42940	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	YML131W	Q03102	365 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	BSP1	Q06604	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	COX1	P00401	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	TOP1	P04786	769 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	YML003W	P0CF16	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	ORC2	P32833	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	HES1	P35843	434 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	SSM4	P40318	1319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	AAT1	Q01802	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	COX17	Q12287	69 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	FRE7	Q12333	620 aa		4.59	□□□□□ -1.67
POP8	YBL018C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	LAC1	P28496	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	UBP7	P40453	1071 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	COG1	P53079	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	YAT1	P80235	687 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	VID22	Q05934	901 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	THI7	Q05998	598 aa		4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TPK1	P06244	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	MAK32	P23060	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	DPB3	P27344	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	GSH1	P32477	678 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	FTH1	P38310	465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	IML2	P47031	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	ATP23	P53722	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	ATG23	Q06671	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	SSP2	Q08646	371 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TRM8	Q12009	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	BI2	P03873	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	NUP1	P20676	1076 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	APN1	P22936	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	RAD16	P31244	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	NUP120	P35729	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	MSY1	P48527	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	RIM13	Q03792	727 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	SWT1	Q12104	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	PCT1	P13259	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	YSP3	P25036	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	AXL2	P38928	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	ERV46	P39727	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	DJP1	P40564	432 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	UBX6	P47049	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	SEG1	Q04279	960 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	YDR109C	Q04585	715 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	IRC3	Q06683	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	BAG7	Q12128	409 aa		4.55	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	SPO16	P17122	198 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	PTC6	P25646	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
POP8	YBL018C	SLC1	P33333	303 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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