RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SDH1	Q00711	640 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ARG5,6	Q01217	863 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PPN1	Q04119	674 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ROY1	Q04847	553 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	STE23	Q06010	1027 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ARV1	Q06541	321 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SWA2	Q06677	668 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MLH2	Q07980	695 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ELG1	Q12050	791 aa		2.95	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MGM1	P32266	881 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SFA1	P32771	386 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MDL2	P33311	773 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PEX32	P38292	413 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YHR112C	P38716	378 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	RRM3	P38766	723 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	CTM1	P38818	585 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YDR089W	P38966	869 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ALG5	P40350	334 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	LAM5	P43560	674 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	COG1	P53079	417 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	BUD9	P53226	547 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	INA17	Q02888	182 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YMR018W	Q04364	514 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	AIM32	Q04689	311 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SKG3	Q06315	1026 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MCP2	Q06567	569 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PEX19	Q07418	342 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YEH1	Q07804	573 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	GEP3	Q08622	556 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	AI3	P03877	415 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	CBS1	P14066	229 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	NIP100	P33420	868 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MEF2	P39677	819 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SAW1	P39735	261 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SLZ1	P40167	298 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YNL195C	P40168	261 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PSF2	P40359	213 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PKP1	P40530	394 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YJL107C	P42947	387 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SHE10	P53075	577 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	STP3	Q05937	343 aa		2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	HMG2	P12684	1045 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MRPL25	P23369	157 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YCR061W	P25639	631 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	VID30	P53076	958 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	IMO32	P53219	342 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YNL050C	P53952	270 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ABZ2	Q03266	374 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	USA1	Q03714	838 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	ARG7	Q04728	441 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	GAD1	Q04792	585 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	CUR1	Q06469	252 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YOL159C	Q08300	171 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	APC5	Q08683	685 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YMR084W	A2P2R3	262 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	DIF1	O13577	133 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	COX3	P00420	269 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	STE12	P13574	688 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PIM1	P36775	1133 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MNN2	P38069	597 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MMS4	P38257	691 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	FTH1	P38310	465 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SCC4	P40090	624 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	INA22	P40576	216 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	IRC24	P40580	263 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	TAF4	P50105	388 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MLC1	P53141	149 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	LSB1	P53281	241 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	CIK1	Q01649	594 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	MSC1	Q03104	513 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SPH1	Q06160	661 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	AFT2	Q08957	416 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	YDR215C	Q12240	137 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	COX17	Q12287	69 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	NDJ1	Q12366	352 aa		2.93	□□□□□ -1.94
AI2	Q0055	SPT7	P35177	1332 aa		2.93	□□□□□ -1.94

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