RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 FCGRTP55899 365 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 PNMA3Q9UL41 463 aa28.55■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 CENPFP49454 3210 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 PLCD1P51178 756 aa28.54■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 C19orf81C9J6K1 198 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 EN2P19622 333 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 MTMR2Q13614 643 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.53■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 MYPNQ86TC9 1320 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L10C9JJH3 530 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 ADD2P35612 726 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 SLFNL1Q499Z3 407 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 LCORLQ8N3X6 602 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.52■■■□□ 2.16
PPP1CC-211ENST00000620030 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GH2P01242 217 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PRKCZQ05513 592 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 RAET1EQ8TD07 263 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GABRQQ9UN88 632 aa28.51■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GABPAQ06546 454 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TMOD4Q9NZQ9 345 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa28.5■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 MYH1P12882 1939 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 GRK4P32298 578 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SHMT1P34896 483 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.49■■■□□ 2.158e-9■□□□□ 9.6
PPP1CC-211ENST00000620030 ARMT1Q9H993 441 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.49■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 LOC285556D6RIA3 1793 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 CHGBP05060 677 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 EVX2Q03828 476 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 UBE3CQ15386 1083 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 EMILIN3Q9NT22 766 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ECHDC1Q9NTX5 307 aa28.48■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 PRKAB2O43741 272 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 FLT3LGP49771 235 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 MTFR1Q15390 333 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 ABCB5Q2M3G0 1257 aa28.46■■■□□ 2.15
PPP1CC-211ENST00000620030 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 MBD4O95243 580 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 USP17L2Q6R6M4 530 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.45■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 GUCY1A2P33402 732 aa28.44■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 CABP5Q9NP86 173 aa28.44■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.44■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2D6P10635 497 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 IRF5Q13568 498 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 RAB3GAP1Q15042 981 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 COA7Q96BR5 231 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 C12orf42Q96LP6 360 aa28.43■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ADCY3O60266 1144 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ACER1Q8TDN7 264 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa28.42■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 MGAMO43451 1857 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 HERVK_113P62684 666 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 PXYLP1Q8TE99 480 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 TAOK2Q9UL54 1235 aa28.41■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 BRCA2P51587 3418 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 GJD2Q9UKL4 321 aa28.4■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 PEX10O60683 326 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 CCL5P13501 91 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 UBXN2AP68543 259 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 SEPT2Q15019 361 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 TSHZ3Q63HK5 1081 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 DYNLL2Q96FJ2 89 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 GPATCH3Q96I76 525 aa28.39■■■□□ 2.14
PPP1CC-211ENST00000620030 ELNP15502 786 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 USP14P54578 494 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 C12orf60Q5U649 245 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC44A5Q8NCS7 719 aa28.38■■■□□ 2.13
PPP1CC-211ENST00000620030 CRBNQ96SW2 442 aa28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms