RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587215.1

PKN1-209, Transcript of protein kinase N1, humanhuman

TSL 3

Gene PKN1, Length 363 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1-209ENST00000587215 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.16■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 19.1
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PKN1-209ENST00000587215 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 BCL11AQ9H165 835 aa20.15■□□□□ 0.82
PKN1-209ENST00000587215 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.15■□□□□ 0.82
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PKN1-209ENST00000587215 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 PDE6AP16499 860 aa20.14■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 C19orf81C9J6K1 198 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 USP17L10C9JJH3 530 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 ADCY3O60266 1144 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 CCL5P13501 91 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 PLCD1P51178 756 aa20.13■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 SHISA4Q96DD7 197 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 EHD4Q9H223 541 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.13■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.12■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 IRF5Q13568 498 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 TTC6Q86TZ1 520 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.12■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 GJB1P08034 283 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 ELNP15502 786 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 ATP5JP18859 108 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 UBXN2AP68543 259 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 COA7Q96BR5 231 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 RNF208Q9H0X6 261 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 GJD2Q9UKL4 321 aa20.11■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 PEX10O60683 326 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 GJA8P48165 433 aa20.1■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.1■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 MYH1P12882 1939 aa20.1■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.09■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 HERVK_113P62684 666 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 GABPAQ06546 454 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 LCORLQ8N3X6 602 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 HAUS7Q99871 368 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.08■□□□□ 0.81
PKN1-209ENST00000587215 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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PKN1-209ENST00000587215 GUCY1A2P33402 732 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 ADD2P35612 726 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 Q3C1V9 767 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.07■□□□□ 0.8
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PKN1-209ENST00000587215 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.07■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.07■□□□□ 0.8
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PKN1-209ENST00000587215 ACER1Q8TDN7 264 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 C12orf42Q96LP6 360 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.06■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 PRKAB2O43741 272 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 CABP5Q9NP86 173 aa20.05■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 CYP2D6P10635 497 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 GCC1Q96CN9 775 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 DCTPP1Q9H773 170 aa20.04■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 USP17L15C9J2P7 530 aa20.03■□□□□ 0.8
PKN1-209ENST00000587215 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.03■□□□□ 0.8
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