RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CATIPQ7Z7H3 387 aa19■□□□□ 0.63
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP2D6P10635 497 aa18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSD3B7Q9H2F3 369 aa18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ROBO3Q96MS0 1386 aa18.92■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MYO1BO43795 1136 aa18.91■□□□□ 0.62
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
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