RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 IQCA1Q86XH1 822 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 SBF2Q86WG5 1849 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 NEMFO60524 1076 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PNOCQ13519 176 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 NCAPHQ15003 741 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 KRBA2Q6ZNG9 492 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 SHISA4Q96DD7 197 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 USP21Q9UK80 565 aa26.68■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 SMTNL1A8MU46 457 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 EVX2Q03828 476 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 ARID5BQ14865 1188 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PKN1Q16512 942 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 LONRF3Q496Y0 759 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 ORC4O43929 436 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PTPREP23469 700 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 ISM2Q6H9L7 571 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.66■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB22O15209 634 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 CALM1P0DP23 149 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 CALM2P0DP24 149 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 CALM3P0DP25 149 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 TPM4P67936 248 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 TROAPQ12815 778 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 IKBKBO14920 756 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 DDAH1O94760 285 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 GRIN1Q05586 938 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 SPECC1Q5M775 1068 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 CNNM3Q8NE01 707 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 VPS54Q9P1Q0 977 aa26.65■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 XBP1P17861 261 aa26.64■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 RBM10P98175 930 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
EHD4-202ENST00000569223 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 PHF20Q9BVI0 1012 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 CABP5Q9NP86 173 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 FAM13BQ9NYF5 915 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 JAG2Q9Y219 1238 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 CYP2D6P10635 497 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SBK1Q52WX2 424 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 IFNKQ9P0W0 207 aa26.63■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 NPHP1O15259 732 aa26.62■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 RFC4P35249 363 aa26.62■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.62■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SMC2O95347 1197 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 KRT2P35908 639 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 CCZ1BP86790 482 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa26.61■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 FAM205CA6NFA0 338 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 NMT2O60551 498 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 ATP2B1P20020 1258 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 GSDMDP57764 484 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SLC51AQ86UW1 340 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 FOXN1O15353 648 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 GRAPQ13588 217 aa26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 SKILP12757 684 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 NFIXQ14938 502 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.59■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 MYL5Q02045 173 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 OLFM4Q6UX06 510 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 TRIM75PA6NK02 468 aa26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
EHD4-202ENST00000569223 FANCCQ00597 558 aa26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms