RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 LPAR1Q92633 364 aa11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 BADQ92934 168 aa11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 GAKO14976 1311 aa11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ATAD5Q96QE3 1844 aa11.49□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 CCNA1P78396 465 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ATP2B2Q01814 1243 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 MAP2K5Q13163 448 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ARRDC4Q8NCT1 418 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 TXNRD2Q9NNW7 524 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 RFX7Q2KHR2 1363 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 LTBP2Q14767 1821 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.48□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 TTC28Q96AY4 2481 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 UTYO14607 1347 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 C19orf81C9J6K1 198 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 PEX10O60683 326 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 BACE1P56817 501 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 PPM1EQ8WY54 764 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 PORCNQ9H237 461 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 MUC3AQ02505 3323 aa11.47□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 NEFLP07196 543 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ASNSP08243 561 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 MAP3K12Q12852 859 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 TRIM60Q495X7 471 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 MORN1Q5T089 497 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 USP6NLQ92738 828 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 SIL1Q9H173 461 aa11.46□□□□□ -0.57
SMAD3-215ENST00000560424 USP17L10C9JJH3 530 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 PHKA1P46020 1223 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 GSTO1P78417 241 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 Q3C1V9 767 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 USP38Q8NB14 1042 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 WDR18Q9BV38 432 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 THEGQ9P2T0 379 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 RBPJLQ9UBG7 517 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.45□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 SLC15A5A6NIM6 579 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 LDHCP07864 332 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 DNAJB2P25686 324 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 GRIN2CQ14957 1233 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC102BQ68D86 513 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.44□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 RAG1P15918 1043 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 CYP2C19P33261 490 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 RHBDL3P58872 404 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 MECOMQ03112 1051 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 TEX11Q8IYF3 940 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 ASB2Q96Q27 587 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF576Q9H609 170 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 FLRT1Q9NZU1 646 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 FBXO3Q9UK99 471 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.43□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 CIAO1O76071 339 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 PTPREP23469 700 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 RASGRF1Q13972 1273 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 ATG9AQ7Z3C6 839 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 DPP9Q86TI2 863 aa11.42□□□□□ -0.58
SMAD3-215ENST00000560424 TIFAQ96CG3 184 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms