RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MYH3P11055 1940 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PLSCR1O15162 318 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 GPLD1P80108 840 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ITPK1Q13572 414 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 C20orf204Q6ZNR8 217 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MCM10Q7L590 875 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 IGFLR1Q9H665 355 aa5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SBF1O95248 1867 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB39O15060 712 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SASH3O75995 380 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MICALL1Q8N3F8 863 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 RETREG2Q8NC44 543 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ATG3Q9NT62 314 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 FAM13BQ9NYF5 915 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NRXN2Q9P2S2 1712 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa5.67□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ITGB2P05107 769 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NID1P14543 1247 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MPSTP25325 297 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SOX18P35713 384 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NRLP54845 237 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SIK1P57059 783 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PCSK7Q16549 785 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 AMOTQ4VCS5 1084 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC184Q52MB2 194 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 AKAP4Q5JQC9 854 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 C8orf86Q6ZUL3 223 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 GPR152Q8TDT2 470 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PIK3R5Q8WYR1 880 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 KRBA1A5PL33 1030 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 KCNQ3O43525 872 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MMP20O60882 483 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 LILRB5O75023 590 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TEFQ10587 303 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MTMR3Q13615 1198 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 FAM35AQ86V20 835 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ATCAYQ86WG3 371 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 DNAJC10Q8IXB1 793 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PLVAPQ9BX97 442 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SPON1Q9HCB6 807 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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TMOD3-204ENST00000558666 MIS18AQ9NYP9 233 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NUDCQ9Y266 331 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1B0GUL6 1792 aa5.65□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 CACNA1FO60840 1977 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 NEFMP07197 916 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 PSAPP07602 524 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 CPB1P15086 417 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 CANXP27824 592 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 TTC5Q8N0Z6 440 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF428Q96B54 188 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 MTMR7Q9Y216 660 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 COL15A1P39059 1388 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 SLX4Q8IY92 1834 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 SPDYE3A6NKU9 549 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 ERVV-2B6SEH9 535 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa5.63□□□□□ -1.51
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