RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 TRIM34Q9BYJ4 488 aa17.61■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 BACE1P56817 501 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa17.6■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 MTMR2Q13614 643 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 FAM110CQ1W6H9 321 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 TATDN1Q6P1N9 297 aa17.59■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
CS-229ENST00000551936 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 C19orf81C9J6K1 198 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 USP17L10C9JJH3 530 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GOLIM4O00461 696 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SLC34A2O95436 690 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 PDE6AP16499 860 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 FLT3LGP49771 235 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SLAIN1Q8ND83 568 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 BCL11AQ9H165 835 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 EHD4Q9H223 541 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 DOCK3Q8IZD9 2030 aa17.58■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 PLCD1P51178 756 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 TTC6Q86TZ1 520 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 TMOD4Q9NZQ9 345 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SERPINB13Q9UIV8 391 aa17.57■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ADCY3O60266 1144 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GH2P01242 217 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 CCL5P13501 91 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ATP5JP18859 108 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 UBXN2AP68543 259 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 IRF5Q13568 498 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 COA7Q96BR5 231 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 BOLA2Q9H3K6 86 aa17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SHISA4Q96DD7 197 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 RNF208Q9H0X6 261 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 EMILIN3Q9NT22 766 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 PAG1Q9NWQ8 432 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 MORF4L1Q9UBU8 362 aa17.55■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GJB1P08034 283 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ELNP15502 786 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SHMT1P34896 483 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GJA8P48165 433 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GABPAQ06546 454 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 USP17L2Q6R6M4 530 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 HAUS7Q99871 368 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 LRRCC1Q9C099 1032 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GJD2Q9UKL4 321 aa17.54■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 NAV1Q8NEY1 1877 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ADD2P35612 726 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 HERVK_113P62684 666 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 EVX2Q03828 476 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ABCB5Q2M3G0 1257 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SLFNL1Q499Z3 407 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 LCORLQ8N3X6 602 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 UNC93B1Q9H1C4 597 aa17.53■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 PEX10O60683 326 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 INHAP05111 366 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 Q3C1V9 767 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 POTEEQ6S8J3 1075 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 C12orf42Q96LP6 360 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 ARMT1Q9H993 441 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 TXNRD2Q9NNW7 524 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 CABP5Q9NP86 173 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 MCM9Q9NXL9 1143 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 RBPJLQ9UBG7 517 aa17.52■□□□□ 0.4
CS-229ENST00000551936 GUCY1A2P33402 732 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 RAB3GAP1Q15042 981 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 DCTPP1Q9H773 170 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 PLXNB2O15031 1838 aa17.51■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 PRKAB2O43741 272 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 SGPL1O95470 568 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 CHGBP05060 677 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 USP14P54578 494 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 ACER1Q8TDN7 264 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.5■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 MBD4O95243 580 aa17.49■□□□□ 0.39
CS-229ENST00000551936 CYP2D6P10635 497 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms