RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 GDF11O95390 407 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 LARGE1O95461 756 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PSMA5P28066 241 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 AK2P54819 239 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TFAP4Q01664 338 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PDE4BQ07343 736 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TRDNQ13061 729 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 Q6ZUG5 572 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 USP48Q86UV5 1035 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ESR2Q92731 530 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 KRT23Q9C075 422 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 MKNK2Q9HBH9 465 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 IL17RBQ9NRM6 502 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SWAP70Q9UH65 585 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PLIN4Q96Q06 1357 aa9.62□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TRAF5O00463 557 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TBC1D12O60347 775 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 GUCY1A2P33402 732 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 MCM5P33992 734 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SEC23AQ15436 765 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 RCSD1Q6JBY9 416 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SULF1Q8IWU6 871 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 KLRG1Q96E93 195 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CDCA5Q96FF9 252 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 AGXT2Q9BYV1 514 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 LY9Q9HBG7 655 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.61□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 MYH8P13535 1937 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TNKSO95271 1327 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.6□□□□□ -0.87
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CS-216ENST00000549221 KIF3CO14782 793 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 INPP5BP32019 993 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ST3GAL1Q11201 340 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 LDHDQ86WU2 507 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 BRF1Q92994 677 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SNX21Q969T3 373 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 BRPF3Q9ULD4 1205 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TPCN1Q9ULQ1 816 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.6□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 DTNBO60941 627 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 GH2P01242 217 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TSPY3P0CV98 308 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TSPY8P0CW00 308 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 NOVP48745 357 aa9.59□□□□□ -0.87
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CS-216ENST00000549221 PRKG1Q13976 671 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 SEPT2Q15019 361 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
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CS-216ENST00000549221 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.59□□□□□ -0.87
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CS-216ENST00000549221 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 FBXL16Q8N461 479 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 CEP95Q96GE4 821 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 OTOFQ9HC10 1997 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-216ENST00000549221 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 ST18O60284 1047 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 CAP2P40123 477 aa9.58□□□□□ -0.88
CS-216ENST00000549221 SLC4A3P48751 1232 aa9.58□□□□□ -0.88
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