RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 MPP2Q14168 576 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 DTX1Q86Y01 620 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 HID1Q8IV36 788 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 RNF34Q969K3 372 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.46□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 GRIN3BO60391 1043 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 LRIG2O94898 1065 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 LMNB1P20700 586 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.45□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM87BQ96K49 555 aa6.45□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.45□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 COBLO75128 1261 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 ATE1O95260 518 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 HTR3BO95264 441 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 PGRP06401 933 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 OXCT1P55809 520 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 LEMD3Q9Y2U8 911 aa6.44□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.44□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 SPON2Q9BUD6 331 aa6.42□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.42□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.41□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 PRR33A8MZF0 331 aa6.41□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 BPNT1O95861 308 aa6.4□□□□□ -1.38
CLVS1-209ENST00000522928 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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CLVS1-209ENST00000522928 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CLVS1-209ENST00000522928 VWCEQ96DN2 955 aa6.38□□□□□ -1.39
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