RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	STK38	Q15208	465 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPA	Q15257	358 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ANO1	Q5XXA6	986 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM139	Q8IV31	216 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	VSTM4	Q8IW00	320 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	OSBP2	Q969R2	916 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf76	Q96K31	380 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ST7	Q9NRC1	585 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ATG3	Q9NT62	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	INTS13	Q9NVM9	706 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCC12	Q96J65	1359 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SPEF2	Q9C093	1822 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		5.74	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A087WZG4	1122 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	EYA2	O00167	538 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TULP2	O00295	520 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CCP110	O43303	1012 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP8B1	O43520	1251 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PRC1	O43663	620 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP2C19	P33261	490 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF14	Q5TI25	921 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	RESP18	Q5W5W9	173 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF15	Q8N660	670 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DPF2	Q92785	391 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K14	Q99558	947 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAI1	Q9UI46	699 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TJP1	Q07157	1748 aa		5.73	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMA4	Q16363	1823 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	BIN1	O00499	593 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP27B1	O15528	508 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CBFA2T2	O43439	604 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PPFIA3	O75145	1194 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP6R2	O75170	966 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FGA	P02671	866 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF18	P17022	549 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	BMP6	P22004	513 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMM10	P62072	90 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TPM4	P67936	248 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MYL5	Q02045	173 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC24	Q50LG9	513 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CHST3	Q7LGC8	479 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	KIFC2	Q96AC6	838 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	DCAF5	Q96JK2	942 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ORAI2	Q96SN7	254 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM51	Q9NW97	253 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ATRN	O75882	1429 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ATXN3-212	ENST00000515746	NID2	Q14112	1375 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	COL18A1	P39060	1754 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GUL7	405 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC66	A2RUB6	948 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP6	O43182	974 aa		5.71	□□□□□ -1.5
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR37L1	O60883	481 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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