RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487064.1

RPS3AP50-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 50, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP50, Length 803 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP50-201ENST00000487064 EEA1Q15075 1411 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 NTF4P34130 210 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 LIG3P49916 1009 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 PWP1Q13610 501 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF792Q3KQV3 632 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRDM2Q13029 1718 aa5.65□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SYNJ1O43426 1573 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SORBS3O60504 671 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ITGB5P18084 799 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 BNIP3Q12983 259 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 INPP5AQ14642 412 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 RASIP1Q5U651 963 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC23A3Q6PIS1 610 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 NFXL1Q6ZNB6 911 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 TMC4Q7Z404 712 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPRED2Q7Z698 418 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 CCDC120Q96HB5 630 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SOGA1O94964 1423 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa5.64□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 BPNT1O95861 308 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 CD8BP10966 210 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 IKZF1Q13422 519 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 CRELD1Q96HD1 420 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MIPEPQ99797 713 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 KIF21BO75037 1637 aa5.63□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 TCF3P15923 654 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 GRK4P32298 578 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ETV3P41162 512 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 KIR3DL1P43629 444 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MAP3K11Q16584 847 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 RELL1Q8IUW5 271 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MFSD4AQ8N468 514 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 TNIKQ9UKE5 1360 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa5.62□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 EOMESO95936 686 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PGRP06401 933 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SEPT6Q14141 434 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLC6A19Q695T7 634 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 USP31Q70CQ4 1352 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 FAM214BQ7L5A3 538 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SPACA3Q8IXA5 215 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 VTI1BQ9UEU0 232 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.61□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 GOLGA3Q08378 1498 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 CEP162Q5TB80 1403 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 GFRA2O00451 464 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 ZP2Q05996 745 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 FBRSQ9HAH7 460 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa5.6□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 TOP2BQ02880 1626 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 SLITRK5O94991 958 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 LMNB2Q03252 620 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MLECQ14165 292 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RPS3AP50-201ENST00000487064 HMGXB3Q12766 1538 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP50-201ENST00000487064 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP50-201ENST00000487064 RECKO95980 971 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP50-201ENST00000487064 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP50-201ENST00000487064 AFMP43652 599 aa5.58□□□□□ -1.52
RPS3AP50-201ENST00000487064 CHMP4BP1P59074 171 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms