RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 BACE1P56817 501 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 FEZ1Q99689 392 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 COG6Q9Y2V7 657 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 MYH8P13535 1937 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP290O15078 2479 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 CENPFP49454 3210 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 C19orf81C9J6K1 198 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 PEX10O60683 326 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 HMMRO75330 724 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 SGPL1O95470 568 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 GJA8P48165 433 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 JAG1P78504 1218 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM110CQ1W6H9 321 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 TTC6Q86TZ1 520 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 CABP5Q9NP86 173 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 GH2P01242 217 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP2B6P20813 491 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR78Q5VTH9 848 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 PXYLP1Q8TE99 480 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 SHISA4Q96DD7 197 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 WDR18Q9BV38 432 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-204ENST00000459646 GOLIM4O00461 696 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 EVI5O60447 810 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 IRF5Q13568 498 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PDE3AQ14432 1141 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L2Q6R6M4 530 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CERS3Q8IU89 383 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 DNAJC18Q9H819 358 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 NAV1Q8NEY1 1877 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 HERVK_113P62684 666 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 GINM1Q9NU53 330 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 MCM9Q9NXL9 1143 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 HTTP42858 3142 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF532Q9HCE3 1301 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L15C9J2P7 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L11C9JVI0 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L18D6R9N7 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L22D6RA61 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L19D6RCP7 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L20D6RJB6 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 IGSF3O75054 1194 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 HMGCRP04035 888 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PLCD1P51178 756 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 USP17L24Q0WX57 530 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM32Q13049 653 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 Q3C1V9 767 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 MORF4L1Q9UBU8 362 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 RCAN3Q9UKA8 241 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 GJD2Q9UKL4 321 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PLXNB2O15031 1838 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 MYH7P12883 1935 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 RAB11FIP3O75154 756 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-204ENST00000459646 PDE6AP16499 860 aa10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms