RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GYS1P13807 737 aa21.59■■□□□ 1.05
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALM3P0DP25 149 aa21.58■■□□□ 1.05
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 EP400Q96L91 3159 aa21.56■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC25BP30305 580 aa21.56■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST5P78524 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 OXER1Q8TDS5 423 aa21.56■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.56■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPSM2P81274 684 aa21.55■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.54■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.54■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.53■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PHF20Q9BVI0 1012 aa21.53■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.53■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.52■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 UFL1O94874 794 aa21.52■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTPREP23469 700 aa21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CABP5Q9NP86 173 aa21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.52■■□□□ 1.04
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP4CP60510 307 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAG3O95817 575 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP2B4P23634 1241 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT2P35908 639 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD209Q9NNX6 404 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GGA1Q9UJY5 639 aa21.51■■□□□ 1.03
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRIN1Q05586 938 aa21.5■■□□□ 1.03
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