RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 FGD1P98174 961 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-209ENST00000415046 HDXQ7Z353 690 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-209ENST00000415046 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-209ENST00000415046 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-209ENST00000415046 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRK-209ENST00000415046 CAP2P40123 477 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 FBRSQ9HAH7 460 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 AK5Q9Y6K8 562 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SLITRK5O94991 958 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 CLCN7P51798 805 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 ASB11Q8WXH4 323 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SOGA1O94964 1423 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 NKG7Q16617 165 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 FOXQ1Q9C009 403 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 CDK8P49336 464 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 RNF19AQ9NV58 838 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 IKZF1Q13422 519 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 SEPT6Q14141 434 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 HID1Q8IV36 788 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 FLAD1Q8NFF5 587 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 MIPEPQ99797 713 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 GFRA2O00451 464 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 LIG3P49916 1009 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 FAM168AQ92567 244 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRK-209ENST00000415046 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 C8AP07357 584 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 GRK4P32298 578 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ZP2Q05996 745 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 MFSD4AQ8N468 514 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 PRR33A8MZF0 331 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 LMNB1P20700 586 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 MEI1Q5TIA1 1274 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 NPAS4Q8IUM7 802 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 LMCD1Q9NZU5 365 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 MAP3K11Q16584 847 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 PARP2Q9UGN5 583 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 RLBP1P12271 317 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 DAB2P98082 770 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 RIN3Q8TB24 985 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 CTNND2Q9UQB3 1225 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ADAMTS12P58397 1594 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 JAG1P78504 1218 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 PSMD2Q13200 908 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 ATP13A1Q9HD20 1204 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-209ENST00000415046 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms